macklis získal dvojí S. B. v bioelektrickém inženýrství a literatuře z Massachusetts Institute of Technology. V roce 1984 získal titul M. D. a Ph.D. na Harvard-MIT Program of Health Sciences and Technology (HST), kde mu poradil Richard L.Sidman. Absolvoval postdoktorandské stipendium ve vývojové neurovědě se Sidmanem. Macklis klinicky trénoval interní medicínu v Brigham and Women ‚ s Hospital (BWH) a v neurologii dospělých v neurologickém výcvikovém programu Harvard-Longwood.
Macklis nejprve založil svou laboratoř v základní vědecké divizi neurověd v Bostonské dětské nemocnici (BCH). V roce 2002 se přestěhoval do Massachusetts General Hospital (MGH), kde byl zakládajícím ředitelem Centra pro opravu nervového systému MGH-HMS (2002-2011). On také spolurežíroval program Parkinsonovy choroby a souvisejících poruch na BWH.
v roce 2004 založil Macklis program Neuroscience / Nervous System Diseases na Harvard Stem Cell Institute na Harvardské univerzitě, který řídil do roku 2013. V roce 2007 byl Macklis jmenován profesorem biologických věd Maxe a Anne Wien. Jeho laboratoř se fyzicky přestěhovala do Cambridge, MA v 2011. Je členem fakulty Harvard graduate programs in Neuroscience; biologické a biomedicínské vědy; vývojová a regenerační biologie; a molekuly, buňky,a organismy; stejně jako program Harvard-MIT HST.
Macklis se stal významným vyšetřovatelem skupiny Paul G. Allen Frontiers v roce 2015. V roce 2017 se stal vyšetřovatelem Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).