John Sulston.Autor: Scott Barbour/Getty
zásada, že genomická data by měla být všeobecně sdílena bez komerčního zapojení, vděčí za své široké přijetí do značné míry Johnu Sulstonovi. Jako vedoucí britského příspěvku k mezinárodnímu Projektu lidského genomu, Sulston přesvědčil sponzory a kolegy o zásadním významu zpřístupnění kompletní, vysoce kvalitní sekvence volně dostupná globální vědecké komunitě. Jeho odhodlání pramenilo z morální jistoty, že zisk jako motiv nemá ve vědě místo.
v roce 2002 sdílel Nobelovu cenu za fyziologii nebo medicínu za svůj příspěvek k pochopení toho, jak geny řídí osud buněk u vyvíjejících se škrkavek Caenorhabditis elegans. Sulston ve své práci na linii červových buněk a později na sekvenování genomu propagoval myšlenku, že investice do rozsáhlého sběru dat bez konkrétní hypotézy mají dlouhodobé výhody.
Sulston, který zemřel 6. Března, byl synem anglického duchovního a učitele. Vzal si k srdci lhostejnost svých rodičů k hmotnému bohatství a jejich touhu pracovat pro společné dobro. Mechanici ho fascinovali od útlého věku a pitváním mrtvých zvířat začal vnímat i živé věci jako stroje. Získal stipendium na studium přírodních věd na University of Cambridge ve Velké Británii.
jeho PhD, také v Cambridge, se zabýval syntézou oligonukleotidů-stavebních bloků nukleových kyselin, jako je DNA a RNA. Jeho vkus experimentátora mu zajistil pozici postdoktora s organickou chemičkou Leslie Orgel na Salk Institute for Biological Studies v La Jolla, Kalifornie, zkoumání původu života. Sulston přišel v roce 1966 studovat replikaci nukleových kyselin a poprvé pochopil evoluční kontext své práce v chemii.
tam se také Sulston setkal s Francisem Crickem, spoluobjevitelem dvojité šroubovice DNA; Crick ho doporučil na místo v laboratoři molekulární biologie Rady pro lékařský výzkum zpět v Cambridge. V roce 1969 se Sulston připojil k malé skupině vedené genetikem Sydney Brennerem. Při pohledu na modelový organismus, ve kterém bude zkoumat interakce genů, vývoj a chování, si Brenner vybral C. elegans. Malý červ má pouze 959 buněk jako dospělý, přesto má střeva, nervový systém, pohlavní žlázy a repertoár chování k pohybu, krmení a reprodukci.
je také transparentní. Sulston použil to, co se stalo jeho oblíbeným nástrojem, Nomarski diferenciální interferenční kontrastní mikroskop, k vizualizaci buněčných jader v živých larvách červů a, později, v náročnějších embryích. Pozoroval a zaznamenal invariantní sekvenci buněčných dělení, které vytvářejí dospělého červa. Jeho práce poskytla základ pro budoucí Biology červů, aby odpověděli na otázky týkající se vývoje, které mají důsledky pro jiné druhy, včetně našich vlastních.
Sulston si všiml, že některé buňky jsou během vývoje eliminovány. Genetiku tohoto procesu začal zkoumat s americkým postdoktorem Robertem Horvitzem. Po návratu domů do Massachusetts Institute of Technology v Cambridge objevil Horvitz geny, které regulují programovanou buněčnou smrt. Později se mutace v těchto genech ukázaly jako nápomocné k pochopení nekontrolovaného množení rakovinných buněk. Sulston, Horvitz a Brenner sdíleli Nobelovu cenu za rok 2002 „za objevy týkající se genetické regulace vývoje orgánů a programované buněčné smrti“.
od roku 1983 se Sulston rozhodl zmapovat a sekvenovat genom 100 milionů párů bází červa. Jeho laboratoř pracovala ve spolupráci a přátelské soutěži s Robertem Waterstonem, poté na University of Washington v St.Louis. V roce 1989 jejich kolektivní snaha motivovala Jima Watsona, tehdejšího vedoucího projektu Human Genome Project, k financování jejich pilotní sekvenční iniciativy. Projekt worm prokázal, že automatizované, vysoce výkonné sekvenování lidského genomu nebylo nemožné. V roce 1992 Britská Wellcome Trust pozvala Sulstona, aby vedl své nové sekvenční zařízení, Centrum Sanger (nyní Sanger Institute), v Hinxtonu.
vedoucí Sanger jako součást mezinárodního konsorcia, Sulston měl klíčovou roli při stanovení principů uvolňování dat a otevřeného přístupu. Když v roce 1998 soukromá iniciativa vedená Craigem Venterem z Celera Genomics oznámila svůj záměr nejprve sekvenovat lidský genom a pro komerční zisk, Sulston hájil princip otevřených dat. Stal se, s Francisem Collinsem-tehdejším vedoucím amerického Národního institutu pro výzkum lidského genomu-vedoucím hlasem při přesvědčování jak amerických národních institutů zdraví, tak Wellcome Trust, aby se zavázali k dokončení projektu. Sekvence lidského genomu, dokončená na normu 99.99% přesnost, byl publikován v Nature dne 21. října 2004 (International Human Genome Sequencing Consortium Nature 431, 931-945; 2004).
jak Sulston předpověděl, dostupnost kompletního lidského genomu vedla výzkum, akademický i komerční, po celém světě. Práce pomalu přináší klinické aplikace, zejména v oblastech, jako je rakovina, kde genetické mutace určují, zda bude nádor citlivý na terapii. Mezitím technologie pokročila a náklady klesly tak, že sekvenování celého genomu jednotlivců může být brzy rutinní.
Sulston byl praktický v laboratoři, osobně připravoval knihovnu worm-clone pro mapovací projekt a dešifroval časné sekvenční stroje tak, aby elektronická data mohla být analyzována přímo. Vždy si však cenil spolupracovníků s dovednostmi odlišnými od jeho vlastních, a společně řídili Sangera na palubě sedmi lidí. Když mě požádal, abych spoluautorem knihy o bitvě o lidský genom, společné vlákno, trval na tom, že pracujeme jako rovnocenní partneři.
po zveřejnění lidské sekvence se Sulston věnoval psaní a mluvení na podporu otevřeného přístupu a obecněji vztahu mezi vědou a společností. Vřelý a artikulovaný, zvítězil nad publikem svou pokorou a vášní.
