měl slavný a dlouhodobý spor s bývalým senátorem Vince Fumo. Politická webová stránka PoliticsPA přirovnala vztah ke sporu Hatfield-McCoy během demokratických primárek 2008 pro 1. Senátorský obvod v Pennsylvánském Senátu ve Filadelfii, Dougherty dostal překvapivou porážku Larry Farnese, který byl silně podporován Fumo. Po Doughertyho ústupku, Fumo byl slyšen zpívat “ Doc je mrtvý! Doktor je mrtvý!“
v roce 2003 byl jmenován do seznamu politicky vlivných lidí v Pensylvánii „Power 50“. V roce 2003 byl jmenován do seznamu Pennsylvania Report „Power 75“. V roce 2010 ho časopis Politics označil za jednoho z nejvlivnějších demokratů v Pensylvánii.
v roce 2015 podpořil bývalého radního města Philadelphie Jima Kenneyho za starostu Philadelphie. Jeho podpora byla hnacím faktorem jeho vítězství v přeplněných demokratických primárkách.
v lednu 2019 byl Dougherty obviněn z vyšetřování IBEW Local 98, které ho obvinilo ze zneužití prostředků Unie pro osobní prospěch, mezi mnoha obviněními. Jeho obhajoba v březnu důrazně argumentovala tím, že údajné aktivity byly ve skutečnosti zákonné. Případ se stal poměrně komplikovaným s tím, že někteří obžalovaní žádají, aby byl případ rozdělen mezi různé sporné otázky, v červenci.
