kekkei genkai (血継限;; doslovně znamená „technika omezená na dědičnost krví“ nebo „Limit krevní linie“) jsou schopnosti předávané geneticky v konkrétních klanech. Je možné, že ninja má více než jednu z těchto schopností. Schopnosti kekkei genkai, které fungují okem uživatele, se nazývají djjutsu. Jiné kekkei genkai zahrnují smíchání jednoho typu elementární čakry s jiným, vytvoření nového jedinečného pro uživatele, což je obvykle nemožné pro normální ninja.
Kekkei genkai a jejich související techniky nemohou být učeny nebo kopírovány jinými. Nicméně, kekkei genkai může být dán ostatním. Djjutsu, nebo jiný kekkei genkai izolovaný do jediného orgánu, může být transplantován do těla jiného. Použití těchto orgánů vyžaduje mnohem více čakry než někdo narozený s kekkei genkai. Prvky čakry mohou být také předávány lidem mimo klan, procházením re-modifikace DNA Za účelem získání techniky uvolňování. Nicméně, osoby dovednosti v používání by nebylo zdaleka tak silný jako původní praktik.
ačkoli kekkei genkai jsou obvykle geneticky sdíleny v rámci konkrétního klanu, někdy je jedinečný pouze pro jednu osobu a že ani rodinní příbuzní jej nesdílejí. Zdá se, že jiné kekkei genkai se objevují u jedinců bez známého vztahu, jako je uvolnění lávy,který se objevil v ninja z Kirigakure, Iwagakure, a Kumogakure, zatímco uvolnění magnetu, který se objevil v ninja z Kumogakure i Sunagakure.