Khizr Khoja se ujal trůnu Moghulistanu po porážce Qamar-ud-din Khan Dughlat Timurem v roce 1390.
Tarikh-i-Rashidi Mirza Muhammad Haidar Dughlat říká, že nejmladším synem Tughluka Timura Khána byl Khizir Khwája Khán, a že zatímco byl ještě u prsou své matky, byl zachráněn před krutostí a nepřátelstvím Kamaruddina Mir Ághá, matkou Amira Khudáidáda. Když dítě dosáhlo dvanácti let, jeho přátelé, kteří se stále báli Amira Kamaruddina, ho vzali z Káshgharu.
Amir Khudáidád si přál poslat s sebou několik důvěryhodných mužů, ale Mir Ághá se postavil proti tomuto plánu a řekl: „neposílejte žádného ze svých služebníků, protože když se chlapec stane Khánem, lidé narození v základně se stanou vlivnými a pak prokáží nepřátele sobě a vašim dětem. A dovedou si představit, že lid jim nevěnuje dostatečnou úctu, nýbrž říkají mezi sebou: „to jsou jen služebníci. Z tohoto důvodu raději posílejte jiné než své vlastní držáky-posílejte cizince.“Tak bylo posláno dvanáct mužů a každý se nakonec stal Amirem. Mnoho jejich potomků je nyní naživu. Mezi jejich počet byl Arjirák, z nichž jsou potomci Amirs z Itárji; Tájri z Khwarizmu, z nichž jsou odpruženy Amirs z Kunji; zatímco další byl z kmene Chálish Siádi ; a jeho synové se také stali Amirs, ve stylu Kushji, ale oni jsou také nazýváni Kukildásh.
vzali Khizir Khwája Khán do kopců, které leží mezi Badachshánem a Káshgharem. Ale špehové Kamaruddinu dostali zprávu o svém úkrytu, a tak ho opustil a uprchl do kopců Khotanu. V obavě z objevu pokračoval do Sárigh Ujgur, Jurján a Lob Katak, kde zůstal dvanáct let. Po smrti Kamaruddina bylo hledáno Khizir Khwája Khán a Amir Khudáidád pro něj poslal, odkud se skrýval. Jakmile byl přiveden, Khudáidád svolal lidi dohromady a vychoval ho k Khánství. Tak přišla nádhera Khána, aby osvítila svrchovanost Moghulů, takže záležitosti Moghulistánu prosperovaly. Khán pak uzavřel mír s Amirem Timurem, který s ním uzavřel spojenectví sňatkem s Tavakkulem Khánimem, dívkou z královského Haramu.
