Kinom

tento článek pojednává o termínu v molekulární biologii. Pro rostliny a potraviny, viz Zanthoxylum piperitum.

v molekulární biologii, biochemii a buněčné signalizaci je kinom organismu kompletní sadou proteinových kináz kódovaných v jeho genomu. Kinázy jsou obvykle enzymy, které katalyzují fosforylační reakce (aminokyselin) a spadají do několika skupin a rodin, např. ty, které fosforylují aminokyseliny serin a threonin, ty, které fosforylují tyrosin a některé, které mohou fosforylovat oba, jako jsou rodiny MAP2K a GSK. Termín byl poprvé použit v roce 2002 Gerardem Manningem a kolegy v twin papers analyzujících 518 lidských proteinových kináz a týká se jak proteinových kináz, tak proteinových pseudokináz a jejich vývoje proteinových kináz v eukaryotách. Jiné kinomy byly stanoveny pro rýži, několik hub, hlístic a hmyzu, mořských ježků, Dictyostelium discoideum a proces infekce Mycobacterium tuberculosis. Ačkoli primární sekvence proteinových kináz vykazuje podstatnou divergenci mezi nesouvisejícími eukaryoty, a rozdíly aminokyselin v katalytických motivech umožnily jejich oddělení kinomů do kanonických a pseudokinázových podtypů, variace nalezená v aminokyselinových motivech sousedících s místem skutečné fosforylace substrátů eukaryotickými kinázami je mnohem menší.

vzhledem k tomu, že kinázy jsou hlavním lékovým cílem a hlavním kontrolním bodem v chování buněk, byl kinom také cílem rozsáhlé funkční genomiky s obrazovkami RNAi a snah o objevování léků, zejména v léčbě rakoviny.

u zvířat zahrnuje kinom kinázy, které fosforylují pouze tyrosin (tyrosinkinázy), ty, které působí na serin nebo threonin, a několik tříd, jako je GSK3 a MAP2K, které mohou působit na obě. Výzkum ukázal, že existují specializované proteinové domény, které se vážou na fosforylované serinové a threoninové zbytky, jako jsou domény BRCA a FHA.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.