v polovině 1610s, Shah Abbas já obnovil jeho úsilí přivést Gruzii úplněji do Safavid říše a podrobil Kakheti opakovaným invazím v 1614, 1615 a 1616. V sérii gruzínských povstání a íránských represí bylo zabito šedesát až sedmdesát tisíc lidí a více než sto tisíc Kakhetských rolníků bylo násilně deportováno do Íránu. Populace Kakheti klesla o dvě třetiny; kdysi vzkvétající města, jako Gremi a Zagemi, zmenšil se na nevýznamné vesnice; zemědělství klesalo a obchod se zastavil.:50-51 do roku 1648 byl neúnavný Taimuraz konečně vyhnán z Kakheti. Safavidská vláda zpřísnila kontrolu nad Kakheti, zavedla politiku nahrazování domorodého obyvatelstva kočovnými Turkickými kmeny. Současně horolezci Dagestani začali útočit a kolonizovat Kakhetské pochody.
v 1659, Kakhetians představil všeobecné povstání, zmařit Safavid plány usadit desítky tisíc Turkomans v Kakheti. Přesto Kakheti zůstal pod íránskou politickou kontrolou; tři aristokratičtí vůdci povstání se vzdali a byli popraveni. O několik let později, Vakhtang V Shah-Nawaz, muslimský Gruzínský král / vali Kartli, se podařilo získat šáhovo povolení instalovat svého syna Archila jako krále / vali v Kakheti. Na nějaký čas, dvě království východní Gruzie byla prakticky sjednocena pod Shah-Nawazem a jeho synem, a následovalo období relativního míru. Díky tomu, že město Telavi bylo jeho hlavním městem, místo Gremi, které bylo zničeno íránskými invazemi, se Archil rozhodl provést program rekonstrukce. Slibná situace však měla krátké trvání. Archilův vzestup v Kakheti znamenal začátek soupeření mezi dvěma větvemi Bagrationi-Mukhrani, ke kterému Archil patřil – a Dům Kakheti, zbavený koruny v osobě Teimuraza i. tento dům nakonec uspěl, na úkor jejich odpadlictví od islámu, v obnovení sebe v 1703, a vládl, od nynějška, na potěšení jejich Safavid suzerains. To se ukázalo jako málo přínosné, nicméně, a království bylo nadále sužováno neustálými dagestanskými nájezdy.
od roku 1724 do roku 1744 byl Kakheti podroben postupným osmanským a íránským okupacím. Služba, kterou Kakhetský princ Teimuraz II. poskytl Naderovi Šáhovi z Íránu v boji proti Osmanům, však vyústila v zrušení těžkého hold, který Kakheti zaplatil íránskému soudu v roce 1743. V 1744, jako odměna za jejich loajalitu, Nader udělil kingship Kartli Teimuraz II a to Kartli jeho synovi Erekle II. oba panovníci byli korunováni v souladu s křesťanskou tradicí v 1745. Využili nepokojů v Íránu, které následovaly po naderově atentátu v roce 1747, a etablovali se jako prakticky nezávislí vládci. Jejich vláda pomohla stabilizovat zemi; ekonomika začala oživovat a útoky Dagestani byly sníženy, ale nebyly odstraněny. Když Teimuraz zemřel 8. ledna 1762, Erekle ho následoval, čímž sjednotil východní Gruzii jako jediný stát poprvé za téměř tři století ve formě království Kartli-Kakheti.