tradiční klasifikace uložila rozdělení na rostlinné a živočišné formy na jednobuněčné eukaryoty nebo protisty; v současném pohledu jsou protisté různorodým seskupením skupin podobných rostlinám, zvířatům a houbám. Jejich klasifikace do kmenů je obtížná kvůli jejich relativně jednoduché struktuře a omezenému geologickému záznamu, ale studium ultrastruktury a dalších charakteristik poskytuje nový pohled na protistovu klasifikaci. Jsou diskutovány možné klasifikace a je navržena souhrnná klasifikace živého světa do království (Monera, Protista, houby, Animalia, Plantae) a phyla. Tato klasifikace také naznačuje seskupení kmenů do superphyly a formy-superphyly a rozšířeného království Protista (včetně zelených řas, oomycotes a slizových forem, ale s výjimkou červených a hnědých řas). Klasifikace se tak snaží nabídnout kompromis mezi protistickým a protoktistickým královstvím Whittaker a Margulis a spojit úplný seznam kmenů se seskupením těchto pro synoptickou léčbu.
