variace mezi klouby v iniciaci a progresi degenerace lze částečně vysvětlit metabolickými, biochemickými a biomechanickými rozdíly. Ve srovnání s chrupavkou v kolenním kloubu má chrupavka kotníku vyšší obsah proteoglykanů a vody, stejně jako zvýšenou rychlost obratu a syntézy proteoglykanů, z nichž všechny jsou zodpovědné za zvýšenou tuhost a sníženou propustnost. Chondrocyty v chrupavce kotníku mají sníženou odpověď na katabolické faktory, jako jsou fragmenty interleukinu-1 a fibronektinu, ve srovnání s chondrocyty kolenní chrupavky. Navíc, v reakci na poškození, chondrocyty kotníku syntetizují proteoglykany vyšší rychlostí, než je tomu v chondrocytech kolenní chrupavky, což naznačuje větší kapacitu pro opravu. Kromě chrupavek obou kloubů reagují základní kosti také odlišně na degenerativní změny. Dohromady mohou tyto metabolické, biochemické a biomechanické rozdíly poskytnout ochranu kotníku.
