Samuel Jenness, PhD

jsem epidemiolog infekčních nemocí specializující se na matematické a výpočetní přístupy ke studiu ovladačů a preventivních strategií infekčních chorob prostřednictvím rámce dynamických přenosových sítí.

jako odborný asistent na Katedře epidemiologie na Rollins School of Public Health na Emory University vedu výzkumnou laboratoř EpiModel a také spolupracuji na několika projektech v metodách i aplikacích pro epidemiologii infekčních chorob.

výzkumné zájmy

můj metodický výzkum se zaměřuje na vývoj open-souce softwarové platformy pro epidemické modelování, EpiModel, která umožňuje uživatelům vytvářet, simulovat a analyzovat složité mechanistické modely pro přenos libovolně definovaných systémů infekčních chorob. EpiModel poskytuje výkonnou sadu nástrojů pro modelování dynamických kontaktních sítí, které jsou často zásadní pro reprezentaci přenosu nemocí vyžadujících přímý kontakt. EpiModel byl použit ve více než 50 vědeckých publikacích, a to jak mojí skupinou, tak modelingovými výzkumníky z celého světa!

můj aplikovaný výzkum se zaměřuje na epidemiologii HIV, pohlavně přenosných infekcí a dalších infekčních chorob. Zajímá mě, jak můžeme pomocí mechanistického modelování a síťových vědeckých rámců porozumět příčinám těchto nemocí, a navrhnout a vyhodnotit účinné strategie prevence. Nedávné aplikace používaly modely k simulaci společného oběhu více cirkulujících patogenů ve stejné populaci, protože rizikové faktory pro získání jedné nemoci mohou záviset na epidemické dynamice jiných infekcí přenášených podél stejné kontaktní sítě.

obecněji řečeno, práce mé výzkumné laboratoře EpiModel zahrnuje řešení těchto otázek výzkumem v následujících oblastech:

  • epidemiologie infekčních chorob
  • mechanistické/Matematické modelování infekčních nemocí
  • Síťová věda
  • kauzální inferenční metody pro epidemiologii
  • průzkum výzkum design a analýza
  • výpočetní epidemiologie & vývoj vědeckého softwaru

aktivně podporuji a mentoruji doktorandy, post-dokumenty a výzkumné pracovníky, kteří se mnou pracují v těchto oblastech.

novinky

2020

2020-11-15

nový článek publikovaný v AIDS: modelování integrovaného kontinua prevence a péče o HIV k dosažení končících cílů epidemie HIV

2020-09-30

nový předběžný tisk v medRxiv: předpokládaný výskyt HIV a bakteriální STI po sexuálním distancování a přerušení klinické služby související s COVID

2020-09-03

nový článek vedený Kevinem Maloneym publikovaný v časopise Journal of Infectious Diseases: Předpokládaný dopad souběžně dostupné dlouhodobě působící injekční a denní perorální Preexpoziční profylaxe HIV

2020-09-30

nový předtisk v medRxiv: modelování dynamických síťových strategií pro řízení SARS-CoV-2 na výletní lodi

2020-07-23

nový článek vedený Christinou Chandra publikovaný v Klinické infekční nemoci: Mezery v screeningu pohlavně přenosných infekcí u mužů, kteří mají Sex s muži během přípravné péče ve Spojených státech

2020-07-01

nový dokument vedený Kristin Nelsonovou publikovaný v American Journal of Epidemiology: modelování chybějících případů a přenosových vazeb v sítích extenzivně rezistentní tuberkulózy v KwaZulu-Natal, Jižní Afrika

2020-03-01

nový článek vedený Kevinem Weissem publikovaný v JAIDS: Odhadovaný počet mužů, kteří mají Sex s muži s indikací profylaxe před expozicí HIV v národní studii sexuální sítě

2020-03-01

nový dokument vedený Stephenem Uongem publikovaný v epidemiologii: posouzení platnosti stupně sexuální sítě u mužů, kteří mají Sex s muži pomocí prospektivních Kohortových dat

2020-01-24

nový dokument vedený Kevinem Weissem publikovaný v Epidemics: egocentrické sexuální sítě mužů, kteří mají Sex s muži ve Spojených státech: Výsledky studie ARTnet

2019

2019-11-01

nový článek vedený Kevinem Weissem publikovaný v sexuálně přenosných nemocech: epidemiologický dopad zrychlené partnerské terapie pro muže, kteří mají Sex s muži: modelovací studie

2019-10-25

nový článek vedený Kevinem Weissem publikovaný v otevřeném fóru infekční nemoci: Optimalizace pokrytí versus frekvence pro screening pohlavně přenosných infekcí u mužů, kteří mají Sex s muži

2019-06-07

nový dokument vedený Jebem Jonesem publikovaný v sexuálně přenosných nemocech: podíl případů HIV u mužů, kteří mají Sex s muži, které lze přičíst kapavce a chlamydiím: modelovací analýza.

2018

2018-10-11

nový článek publikovaný v American Journal of Epidemiology: Řešení mezer v prevenci před expozicí HIV péče o snížení rasových rozdílů ve výskytu HIV ve Spojených státech.

2018-07-29

nový článek publikovaný v sexuálně přenosných nemocech: míra screeningu bakteriálních STI podle symptomatického stavu u mužů, kteří mají Sex s muži ve Spojených státech: hierarchická Bayesovská analýza.

2018-07-12

obdržel nové hlavní financování výzkumu (moje první financování R01 jako PI) od NIH / NIAID (R01 AI138783) pro projekt vývoje a rozšíření platformy EpiModel pro řešení nové generace důležitých vědeckých otázek prevence HIV/STI.

2018-06-18

nový komentář publikovaný v Clinical Infectious Diseases: posun vpřed s léčbou kapavky pro uživatele profylaxe Předexpozice viru lidské imunodeficience vzhledem k hrozbě antimikrobiální rezistence.

2018-04-20

nový článek publikovaný v časopise Journal of Statistical Software: EpiModel: balíček R pro matematické modelování infekčních nemocí v sítích.

2017

2017-09-01

nový článek publikovaný v Clinical Infectious Diseases: Incidence kapavky a chlamydií po profylaxi Předexpozice viru lidské imunodeficience u mužů, kteří mají Sex s muži: modelovací studie.

2017-02-15

Obdržel jsem první financování NIH jako PI (R21 MH112449) pro novou studii, která shromáždila národní vzorek síťových dat o MSM pro místní modelování dynamiky přenosu HIV/STI a příležitostí k prevenci.

2017-01-06

nový článek publikovaný v PLoS One: individuální riziko HIV versus populační dopad kompenzace rizika po zahájení profylaxe před expozicí HIV u mužů, kteří mají Sex s muži.

2016

2016-12-01

Journal of Infectious Disease issue with our HIV PrEP model was published in the December 15 problém, a představoval umělecká díla z naší studie na obálce problému.

2016-09-01

začal nový vztah s Northwestern Center for Prevention Implementation Methodology (CePIM) jako výzkumný pracovník v rané fázi, s financováním na provádění vědeckého výzkumu sítě a implementace v příštích 5 letech.

2016-07-14

nový článek publikovaný v časopise Journal of Infectious Diseases: dopad pokynů pro profylaxi PŘEDEXPOZICE HIV Centra pro kontrolu nemocí pro muže, kteří mají Sex s muži ve Spojených státech

2016-06-13

nový článek publikovaný v časopise sexuálně přenosné infekce: účinnost kombinovaných balíčků pro prevenci HIV-1 v subsaharské Africe závisí na struktuře partnerské sítě: studie matematického modelování

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.