Harvard Medical School
Oddělení biologické chemie a molekulární farmakologie (BCMP)
240 Longwood Ave., Budova C2, pokoje 315-325
Boston, MA 02115
molekulární mechanismy transkripční regulace jsou mezi eukaryoty vysoce konzervovány. Transkripční regulace v reakci na environmentální a vývojové podněty je zprostředkována kombinatorickým a synergickým působením specifických aktivátorů a represorů vázajících DNA na složky obecného transkripčního aparátu a aktivity modifikující chromatin.
většina práce v této laboratoři kombinuje genetické, molekulární a genomické přístupy dostupné v kvasinkách k řešení základních otázek o transkripčních regulačních mechanismech v živých buňkách. Současné projekty zahrnují 1) genetické experimenty k testování našeho tříkrokového modelu pro umístění nukleosomů; 2) systematická analýza obecných transkripčních faktorů zapojených do iniciace pomocí systému ukotvení; 3) studie faktorů zapojených do elongace a deplece nukleosomů na 3 ‚koncích; 4) pomocí přímého sekvenování RNA, genomové analýzy poločasu mRNA a tvorby 3‘ konce, 5) použití funkčního evolučního přístupu k pochopení rolí různých transkriptů, jakož i specifických složek transkripčních koaktivátorů a co-represorových komplexů a aktivátorových a represorových vazebných míst zprostředkovávajících reakce prostředí.
transkripční regulační obvody zapojené do buněčné transformace mají zásadní význam a samozřejmě přímo relevantní pro rakovinu. Používáme dva izogenní modely (prsní buňky a fibroblasty) lidské rakoviny k objasnění transkripčních regulačních obvodů zapojených do procesu buněčné transformace. To zahrnuje mechanistické experimenty na smyčce zánětlivé zpětné vazby a souvisejících aspektech procesu buněčné transformace; profily celého genomu mRNA, mikroRNA, a místa vázající transkripční faktor, která poskytují integrovaný pohled na buněčnou transformaci; a identifikace genů, mikroRNA, a regulační cesty zapojené do generování rakovinných kmenových buněk a mammosfér. Projekty zahrnují 1) mRNA, miRNA a linc RNA profilování sfér vs. rakovinné buňky v různých typech rakovinných buněk; 2) profilování ribozomu během buněčné transformace; a 3) rozsáhlé experimenty ChIP-Seq k určení role transkripčních faktorů v transformaci. Konečně, když jsme zjistili, že lék na cukrovku metformin selektivně zabíjí rakovinné kmenové buňky, zkoumáme mechanismus účinku metforminu a jeho potenciál pro prevenci a léčbu rakoviny.
