Haplogroup L2 (mtDNA)

L2 har fem hovedunderhaplogrupper: L2a, L2b, L2c, L2d og L2e. af disse slægter er den mest almindelige underklasse L2a, som findes i både Afrika og Levanten.

haplogruppe L2 er blevet observeret blandt eksemplarer på økirkegården i Kulubnarti, Sudan, der stammer fra den tidlige kristne periode (550-800 e.kr.).

haplogruppe L2aEdit

L2a er udbredt i Afrika og den mest almindelige og udbredte afrikanske haplogruppe syd for Sahara og er også noget hyppig på 19% i Amerika blandt efterkommere af afrikanere (Salas et al., 2002). L2a har en mulig oprindelsesdato ca. 48.000 YBP.

det er særligt rigeligt i Tchad (38% af prøven; 33% udifferentierede L2 blandt Tchad-arabere,) og I ikke-Bantu-populationer i Østafrika (Kenya, Uganda og Tansania) på 38%. 33% i Ghana og 32% i Ghana.

denne underklasse er karakteriseret ved mutationer ved 2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 og 16294. Det repræsenterer 52% af den samlede L2 og er den eneste underklasse af L2, der er udbredt over hele Afrika.

den brede fordeling af L2a og mangfoldighed gør det vanskeligt at identificere en geografisk oprindelse. Hovedpuslespillet er den næsten allestedsnærværende haplogruppe L2a, som muligvis har spredt sig øst og vest langs Sahel-korridoren i Nordafrika efter det sidste glaciale maksimum, eller oprindelsen af disse udvidelser kan ligge tidligere i begyndelsen af den senere stenalder, karrus for 40.000 år siden.

i Østafrika blev L2a fundet 15% i Nildalen–Nubia, 5% af egypterne, 14% af Cushittalere, 15% af semitiske Amhara-Folk, 10% af Gurage, 6% af Tigray-Tigrinya-folk, 13% af etiopierne og 5% af Yemenierne.

haplogruppe L2a vises også i Nordafrika, med den højeste frekvens 20% Tuareg, Fulani (14%). Findes også blandt nogle Algeriet arabere, det findes på 10% blandt marokkanske arabere, nogle marokkanske Berbere og Tunesiske Berbere. (1997) et al., (vigilant 1991) et al. 1991.

hos patienter, der får lægemidlet stavudin til behandling af HIV, er haplogruppe L2a forbundet med en lavere sandsynlighed for perifer neuropati som en bivirkning.

haplogruppe L2a1Edit

L2a kan yderligere opdeles i L2a1, der huser overgangen ved 16309 (Salas et al. 2002).

denne underklasse observeres ved forskellige frekvenser i Vestafrika blandt Malinke, Ulof og andre; blandt Nordafrikanerne;i Sahel blandt Hausa, Fulbe og andre; i Centralafrika blandt Bamileke, Fali og andre; i Sydafrika blandt khoisan-familien inklusive Khvi og Bantu-højttalere; og i Østafrika blandt Kikuyu fra Kenya.

alle L2-klader, der er til stede i Etiopien, stammer hovedsageligt fra de to underklasser, L2a1 og L2b. L2a1 er defineret ved mutationer ved 12693, 15784 og 16309. De fleste Etiopiske l2a1-sekvenser deler mutationer ved nps 16189 og 16309. Imidlertid, mens flertallet (26 ud af 33) afroamerikanere deler haplogruppe L2a komplette sekvenser kunne opdeles i fire underklasser ved substitutioner ved nps L2a1e-3495, L2a1a-3918, L2a1f-5581og L2a1i-15229. Ingen af disse sekvenser blev observeret i Etiopiske 16309 L2a1-prøver. (Salas 2002) et al.

haplogruppe L2a1 er også observeret blandt Mahra (4, 6%).

haplogruppe L2a1 er fundet i gamle fossiler forbundet med præ-keramik neolitisk kultur på Tell Halula, Syrien. En prøve udgravet på savannens Pastorale Neolitiske Sted i Italien Bar også L2a1-kladen. Blandingsklyngeanalyse viste yderligere, at individet bar betydelig herkomst fra den gamle Levant, bekræfter forfædres bånd mellem skaberne af savannen Pastoral neolitisk og præ-keramik neolitisk.

haplogruppe L2a1aEdit

underklasse L2a1a er defineret ved substitutioner ved 3918, 5285, 15244 og 15629. Der er to L2A-klynger, der er godt repræsenteret i sydøstlige afrikanere, L2a1a og L2a1b, begge defineret ved overgange i ret stabile HVS-i-positioner. Begge disse ser ud til at have en oprindelse i Vestafrika eller Nordvestafrika (som angivet ved fordelingen af matchende eller nærliggende typer) og at have gennemgået en dramatisk ekspansion enten i Sydøstasien eller i en befolkning forfædre til nutidens sydøstlige afrikanere.

de meget nylige starbursts i underklasser L2a1a og L2a2 foreslår en underskrift for bantu-udvidelserne, som også foreslået af Pereira et al. (2001).

L2a1a er defineret ved en mutation ved 16286. L2a1a-grundlæggerkandidaten dateres til 2.700 (SE 1.200) år siden. (Pereira et al. 2001). Imidlertid l2a1a, som defineret ved en substitution at (np 16286) (Salas et al. 2002), understøttes nu af en kodning-Region markør (np 3918) (fig. 2A) og blev fundet i fire af seks yemenitiske l2a1-slægter. L2a1a forekommer med sin højeste frekvens i det sydøstlige Afrika (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). Både den hyppige grundlægger haplotype og afledte slægter (med 16092-mutation) fundet blandt Yemenier har nøjagtige matches inden for Mosambiske sekvenser (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). L2a1a forekommer også med en mindre frekvens i Nordvestafrika, blandt Maure og Bambara i Mali og Mauretanien. (Rando et al. 1998; Maca-Meyer et al. 2003)

haplogruppe L2a1a1rediger

L2a1a1 er defineret ved markører 6152C, 15391t, 16368c

haplogruppe L2a1rediger

L2a1b er defineret ved substitutioner ved 16189 og 10143. 16192 er også almindelig i L2a1b og L2a1c; det vises i Nordafrika i Egypten, det vises også i det sydøstlige Afrika, og det kan derfor også være en markør for bantu-udvidelsen.

haplogruppe L2a1cEdit

L2a1c deler ofte mutation 16189 med L2a1b, men har sine egne markører ved 3010 og 6663. 16192 er også almindelig i L2a1b og L2a1c; det vises i det sydøstlige Afrika såvel som Østafrika. Dette antyder en vis diversificering af denne klade in situ.

positioner T16209C C16301T C16354T oven på L2a1 definerer en lille underklade, kaldet L2a1c af Kivisild et al. (2004, figur 3) (Se også Figur 6 i Salas et al. 2002), der hovedsageligt forekommer i Østafrika (f.eks. Sudan, Nubia, Etiopien), blandt Turkana og Vestafrika (f. eks.

i Tchad-bassinet blev der identificeret fire forskellige l2a1c-typer et eller to mutationstrin fra de Øst-og Vestafrikanske typer. (Kivisild et al.) 2004. (citat på side.9 eller 443)

haplogruppe L2a1c1rediger

L2a1c1 har en nordafrikansk Oprindelse. Det er defineret af markører 198, 930, 3308, 8604, 16086. Det observeres i Tunesien sefardiske, Askenasiske, jøder, Hebræere, marokkanere, egyptere, Nubere og Yemenere.

haplogruppe L2a1f

Khosian, Madagaskar

haplogruppe L2a1kEdit

L2a1k er defineret af markørerne G6722A og T12903C. det blev tidligere beskrevet som en europæisk-specifik underklasse L2a1a og påvist i tjekker og slovakker.

haplogruppe L2a1l2aEdit

L2a1l2a er anerkendt som en “Ashkenasi-specifik” haplogruppe, set blandt Ashkenasiske jøder med herkomst i Central-og Østeuropa. Det er også blevet påvist i mindre antal i tilsyneladende ikke-jødiske polske befolkninger, hvor det formodes at være kommet fra Askenasisk blanding. Imidlertid udgør denne haplotype kun en meget lille andel af mitokondrie–slægter; forskellige undersøgelser (inklusive Behar ‘ er) har sat dens forekomst på mellem 1,4-1,6%.

haplogruppe L2a2Edit

L2a2 er karakteristisk for Mbuti-Pygmerne.

haplogruppe L2b ‘Cedit

L2b’ C udviklede sig sandsynligvis for omkring 62.000 år siden.

Haplogroup L2bEdit

denne underklasse findes overvejende i Vestafrika, men den er spredt over hele Afrika.

haplogruppe L2cEdit

L2c er hyppigst i Vestafrika og kan være opstået der. Specielt til stede i Senegal på 39%, Kap Verde 16% og Guinea-Bissau 16%.

haplogruppe L2dEdit

L2d er hyppigst i Vestafrika, hvor det kan være opstået. Den findes også i Yemen og Sudan.

haplogruppe L2eEdit

L2e (tidligere L2d2) er typisk i Vestafrika. Det findes også i Tunesien og blandt Mandinka-folk fra Guinea-Bissau og afroamerikanere.