Janet Gyatso er specialist i buddhistiske studier med koncentration om tibetansk og sydasiatisk Kultur-og intellektuel historie. Hendes bøger inkluderer” Apparitions of the Self: The Secret Autobiographies of a Tibetan Visionary”;” i hukommelsens spejl: refleksioner om Mindfulness og erindring i indisk og Tibetansk Buddhisme”; og”kvinder i Tibet”. Hun har for nylig afsluttet en ny bog, “at være menneske i en buddhistisk verden: En intellektuel historie om medicin i det tidlige moderne Tibet ” (Columbia University Press, 2015), der fokuserer på alternative tidlige moderniteter og sammenhænge og uoverensstemmelser mellem religiøse og videnskabelige epistemologier i tibetansk medicin i det sekstende–attende århundrede. Hun har også skrevet om køn og køn i buddhistisk kloster, og om den nuværende kvindelige ordinationsbevægelse i buddhismen. Tidligere emner for hendes stipendium har inkluderet visionær åbenbaring i buddhismen; Slægt, hukommelse, og forfatterskab; oplevelsesfilosofien; selvbiografisk skrivning i Tibet.
Gyatso var præsident for Den Internationale Sammenslutning af tibetanske studier fra 2000 til 2006 og medformand for Buddhism-sektionen i American Academy of Religion fra 2004 til 2010. Hun underviser i forelæsningskurser og avancerede seminarer om buddhistisk historie, ritual og ideer og om tibetansk litterær praksis og religiøs historie. I både undervisning og skrivning trækker hun på kulturel og litterær teori og bestræber sig på at udvide spektret af intellektuelle ressourcer til forståelse af buddhistisk og tibetansk historie. Hun er medlem af Det Naturvidenskabelige Fakultet’ Udvalg om studiet af Religion, Institut for østasiatiske sprog og civilisationer, og Udvalget om indre asiatiske og altaiske studier, og er en aktiv deltager i Harvard Buddhist Studies Forum. Hun er også involveret i udviklingen af et nyt spor til uddannelse af buddhistiske lægministre og ledere i master of divinity-programmet ved Harvard Divinity School (HDS).
Gyatso underviste på Amherst College, før han kom til Harvard som Divinity School ‘ s første Hershey-Professor i buddhistiske studier. I Juli 2014 blev hun HDS prodekan for fakultet og akademiske anliggender.