middelalderen
den middelalderlige fase af japansk filosofi strakte sig fra slutningen af det 12.århundrede gennem det 16. århundrede, en æra med social og politisk omvæltning. Med opløsningen af aristokratiets magt og Samurai-klassens stigning til politisk og militær dominans mistede domstolslivet, der var så centralt i den klassiske periode, sin lokke. Overfor tilbagevendende krigsførelse og en usædvanlig række naturkatastrofer mistede mange japanere interessen for de kosmiske visioner af Shingon og Tendai. De håbede i stedet på en religiøs filosofi rettet mod at føre en fredelig hverdag i det, der var blevet en stadig mere turbulent verden. Buddhistiske splintergrupper (f.eks.
i Kamakura-perioden (1185-1333)—da feudalisme, shogunatet (militærdiktatur) og samurai-krigerklassen blev etableret i Japan-kom nye buddhistiske skoler sammen omkring en række tænkere, der omfattede H-Larsen (1133-1212), Shinran (1173-1263), D-Larsen (1200-53) og Nichiren (1222-82). H. L. og shinran, grundlæggerne af de to vigtigste rene Jordformer af japansk buddhisme, analyserede menneskelig svaghed og behovet for at stole på Amida Buddhas forløsende magt, lysets buddha, der lovede genfødsel i Det Rene Land til de troende. Han brugte meditation som et middel til at analysere filosofiske problemer relateret til bevidsthed og selvet. Nichiren hyldede Hengivenhedens kraft til Lotus Sutra og dets ideal om bodhisattva, eller “buddha-to-be.”Til støtte for denne praksis udarbejdede han en historiefilosofi og en kritik af andre buddhistiske skoler.
på trods af deres forskelle delte Kamakura-filosofferne en bekymring for at forenkle buddhistisk praksis og gøre den tilgængelig for lægfolk i alle klasser. Selv i dag praktiserer de fleste japanske buddhister former for religiøst liv udviklet i Kamakura-perioden. Filosofierne fra disse tænkere påvirker også fortsat mange japanske kulturelle antagelser. Han satte fokus på disciplin ikke som et middel til oplysning, men som et mål i sig selv, mens ren jordkritik af åndelig selvtillid forstærkede en mistillid til opfattelsen af selvet som et isoleret ego. Japanske æstetiske teorier fortsatte med at udvikle sig i middelalderen og afspejlede i stigende grad buddhistiske temaer om løsrivelse, streng praksis og fejring af hverdagen. I løbet af middelalderen, shint Kristian tanke og praksis blev i det væsentlige absorberet i Det buddhistiske religiøse hegemoni. Der var lidt kritisk udvikling af konfuciansk filosofi i denne periode.