han havde en berømt og langvarig fejde med tidligere Senator Vince fumo. Den politiske hjemmeside PoliticsPA sammenlignede forholdet til Hatfield-McCoy fejde under 2008 demokratisk primær for 1.senatorisk distrikt i Pennsylvania Senat i Philadelphia, Dougherty fik et overraskende nederlag af Larry Farnese, der blev stærkt støttet af Fumo. Efter Doughertys indrømmelse blev Fumo hørt synge ” Doc er død! Doc er død!”
i 2003 blev han udnævnt til PoliticsPA “magt 50” liste over politisk indflydelsesrige mennesker i Pennsylvania. I 2003 blev han udnævnt til Pennsylvania rapport “magt 75” liste. I 2010 udnævnte magasinet politik ham til en af de mest indflydelsesrige Demokrater i Pennsylvania.
i 2015 godkendte han tidligere Philadelphia byrådsmedlem Jim Kenney til borgmester i Philadelphia. Hans godkendelse var en drivende faktor i hans sejr i en overfyldt demokratisk primær.
i januar 2019 blev Dougherty tiltalt i en lokal 98-undersøgelse, der anklagede ham for misbrug af EU-midler til personlig fordel, blandt mange beskyldninger. Hans forsvar har argumenteret kraftigt for, at påståede aktiviteter faktisk var lovlige, i Marts. Sagen er blevet ret kompliceret med nogle tiltalte, der beder om, at sagen opdeles mellem forskellige omtvistede spørgsmål, i Juli.