Kinome

denne artikel handler om udtrykket i Molekylærbiologi. For planter og fødevarer, se piperitum.

i Molekylærbiologi, biokemi og cellesignalering er kinomet af en organisme det komplette sæt proteinkinaser kodet i dets genom. Kinaser er normalt katalysatorer, der katalyserer fosforyleringsreaktioner (af aminosyrer) og falder i flere grupper og familier, f.eks. dem, der phosphorylerer aminosyrerne serin og threonin, dem, der phosphorylerer tyrosin og nogle, der kan phosphorylere begge, såsom map2k-og GSK-familierne. Udtrykket blev først brugt i 2002 af Gerard Manning og kolleger i tvillingpapirer, der analyserede de 518 humane proteinkinaser, og henviser til både proteinkinaser og protein pseudokinaser og deres udvikling af proteinkinaser gennem eukaryoter. Andre kinomer er blevet bestemt for ris, flere svampe, nematoder og insekter, søpindsvin, Dictyostelium discoideum og infektionsprocessen ved Mycobacterium tuberculosis. Selvom den primære sekvens af proteinkinaser viser betydelig divergens mellem ikke-relaterede eukaryoter, og aminosyreforskelle i katalytiske motiver har tilladt deres adskillelse af kinomer i kanoniske og pseudokinase-undertyper, variationen, der findes i aminosyremotiverne ved siden af stedet for faktisk phosphorylering af substrater med eukaryote kinaser, er meget mindre.

da kinaser er et stort lægemiddelmål og et vigtigt kontrolpunkt i celleadfærd, har kinomet også været målet for storskala funktionel genomik med RNAi-skærme og for lægemiddelopdagelsesindsats, især inden for kræftterapeutik.

hos dyr inkluderer kinomet kinaser, der kun phosphorylerer tyrosin (tyrosinkinaser), dem, der virker på serin eller threonin, og nogle få klasser, såsom GSK3 og MAP2K, der kan virke på begge. Forskning har vist, at der er specialiserede proteindomæner, der binder til phosphorylerede serin-og threoninrester, såsom BRCA-og FHA-domæner.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.