Kurama-dera sporer sin historie tilbage til år 770 som beskrevet i en gammel beretning bevaret ved templet kaldet anbagai-ji Engi. I disse optegnelser er det skrevet, at den kinesiske munk Ganchrius, discipel af den berømte Jianjenjan (kendt som Ganjin i Japan), boede på hans masters temple, t. Men på en bestemt dag så han en drøm, hvor han blev instrueret om at gå mod nord, hvor en stor mængde åndelig kraft var koncentreret, og tengu og bjergånder siges at bo. Da han kom derhen, blev Ganchkristi håbløst tabt, indtil guden Kibune, min Kristian, dukkede op i en drøm og instruerede ham om at se mod himlen i øst næste morgen for at se et mirakel. Da han gjorde det, munken var chokeret over at se en hvid hest iført en tom sadel, og han fulgte den hest, indtil han ankom til bjerget, der derefter ville blive kaldt Mt. Kurama, stavet med kanji tegn for “hest”og ” sadel”. Der oprettede Gancher en lejr, men han blev snart sat på af en kvindelig oni, der havde til hensigt at fortære ham. Munken skændte med dæmonen og flygtede fra hende og søgte tilflugt i et udhulet træ, hvor han begyndte at bede om frelse. Som svar udryddede Nordens værge, Bishamonten, dæmonen. Takket være Bishamonten etablerede Ganches en lille Hermitage på stedet for at stræbe efter oplysning og tilbede den himmelske Konge.
da hovedstaden flyttede fra Nara til Kyoto i 794, kom mange adelige og hovmænd med, og en mand, Fujivara Issendo, medlem af en uhyre magtfuld klan og forbundet med opførelsen af T-templet i det sydlige Kyoto, sponsorerede opførelsen af et ordentligt tempel på Mt. Kurama to år senere efter at have set en vision om Thousand Arms Kannon. Familien fujivara nedfældede ofte Barmhjertighedens gudinde, Kannon, i de templer, de sponsorerede, så Kurama-dera kom for at tilbede begge guddommelighederne og blev til sidst et Tendai-sekt-tempel. I årenes løb LED komplekset flere brande og blev brændt ned og derefter genopbygget, men hver gang blev skatte og buddhistiske statuer med succes reddet og vendt tilbage til nye hjem.
en af de mest berømte historiske legender fra Heian-perioden, historien om Heike-oprøret, involverer Kurama-dera. Templet var det sted, hvor Minamoto no Yoshitsune (1159-1189), den unge søn af den myrdede herre i Minamoto-klanen, blev placeret af sin fars politiske rivaler, Taira-klanen, for at vokse op som en munk i stedet for en kriger, der senere ville være i stand til at modsætte sig dem. Det fortælles, at på trods af deres hensigt om at gøre en munk af ham, sneg Yoshitsune sig ud i bjergskovene og blev trænet af kongen af tengu i sværdskab, inden han forlod klosterlivet for at genvinde sin families ære og hævne sig på Taira sammen med sine brødre.
Kurama-Dera ændrede sektens troskab flere gange gennem århundrederne, indtil abbed Shigaraki K. Med de forskellige træningsmetoder og stilarter for naturdyrkelse repræsenteret ved Kurama-dera, hvilket gjorde det helt anderledes end andre etablerede skoler, blev det uafhængigt af Tendai-sekten i 1949. Efter grundlæggelsen af denne nye sekt introducerede de dannelsen af en treenighed kendt som Sonten sammensat af Bishamonten, Kannon, og den esoteriske guddom tilbad kun ved Kurama-dera kaldet Goh Kurtma. Kurama-skolen lærer, at livet styres af Kannons barmhjertighed, Bishamontens sandhed og Ma Kursons energi i form af den øverste treenighed Sonten.