Clayton tjente tidligere i LDS-kirken som biskop, stav high councilor, rådgiver i et missionspræsidentskab, regional repræsentant og område halvfjerds. På tidspunktet for hans kald som et område halvfjerds, Claytons boede i Irvine, Californien.
Clayton blev indkaldt som generalautoritet og medlem af De Halvfjerds Første Kvorum i 2001. Tidligere opgaver som generalautoritet har inkluderet at tjene som både rådgiver og som præsident for kirkens sydamerikanske Sydområde og som assisterende Administrerende Direktør for familie-og kirkehistorisk afdeling. Da Clayton blev indkaldt til præsidentskabet for De Halvfjerds den 5. April 2008, blev han tildelt tilsynsansvar for kirkens Nordamerika vest-og Nordamerika nordvestlige områder. Fra 2012 til 2015 overvågede han kirkens arbejde i de tre geografiske områder i Utah. I August 2015 præsiderede Clayton ved banebrydende af kirkens Cedar City Utah Temple.
da LDS-kirken modtog kritik for påstået seksuelt misbrug af drenge i kirkens spejderenheder, der går tilbage årtier, men offentliggøres af beskyldninger i 2015, kommenterede Clayton kirkens igangværende bestræbelser på at forhindre misbrug af børn inden for dens programmer.
fra oktober 2015 til August 2020 var Clayton senior eller præsiderende medlem af formandskabet for De Halvfjerds. Han besatte stillingen tidligere besat af Ronald A. Rasband, der blev kaldet til at tjene i De Tolv Apostles Kvorum. Han blev udpeget som emeritus general authority i Oktober 2020.
i April 2016 blev Claytons bror opretholdt som generalautoritet.
Clayton har været taler ved en række religiøse begivenheder eller fora, der ofte taler om religionsfrihed.