Harvard Medical School
Institut for biologisk kemi og Molekylær farmakologi (BCMP)
240 Langtræ Ave., Bygning C2, værelser 315-325
Boston, MA 02115
de molekylære mekanismer for transkriptionel regulering er stærkt bevaret blandt eukaryoter. Transkriptionel regulering som reaktion på miljømæssige og udviklingsmæssige signaler formidles af den kombinatoriske og synergistiske virkning af specifikke DNA-bindende aktivatorer og undertrykkere på komponenter i det generelle transkriptionsmaskineri og kromatinmodificerende aktiviteter.
meget af arbejdet i dette laboratorium kombinerer genetiske, molekylære og genomiske tilgange, der er tilgængelige i gær for at løse grundlæggende spørgsmål om transkriptionelle reguleringsmekanismer i levende celler. Aktuelle projekter inkluderer 1) genetiske eksperimenter til test af vores tretrinsmodel til nukleosompositionering; 2) en systematisk analyse af generelle transkriptionsfaktorer involveret i initiering ved hjælp af anker-væk-systemet; 3) En undersøgelse af faktorer involveret i forlængelse og nukleosomudtømning ved 3′ ender; 4) ved hjælp af direkte RNA-sekventering, en genom-bred analyse af mRNA-halveringstid og 3′ – end-dannelse, 5) brugen af en funktionel evolutionær tilgang til at forstå rollerne i forskellige transkriptioner såvel som specifikke komponenter i transkriptionelle co-aktivator-og co-repressor-komplekser og aktivator-og repressorbindingssteder, der formidler miljøresponser.
de transkriptionelle reguleringskredsløb, der er involveret i cellulær transformation, er af grundlæggende betydning og naturligvis direkte relevante for kræft. Vi bruger to isogene modeller (brystceller og fibroblaster) af human kræft til at belyse det transkriptionelle regulatoriske kredsløb, der er involveret i processen med cellulær transformation. Dette involverer mekanistiske eksperimenter på den inflammatoriske feedback loop og relaterede aspekter af den cellulære transformationsproces; helgenomprofiler af mRNA ‘er, mikroRNA’ er og transkriptionsfaktorbindingssteder for at give et integreret billede af cellulær transformation; og identificere gener, mikroRNA ‘ er og regulatoriske veje involveret i generering af kræftstamceller og mammosfærer. Projekter inkluderer 1) mRNA, miRNA og linc RNA profilering af kugler vs. kræftceller i forskellige typer kræftceller; 2) ribosomprofilering under cellulær transformation; og 3) store Chipseksek-eksperimenter for at bestemme transkriptionsfaktorers rolle i transformation. Endelig, efter at have opdaget, at diabeteslægemidlet metformin selektivt dræber kræftstamceller, undersøger vi mekanismen for metformins virkning og dets potentiale for forebyggelse og behandling af kræft.
