Das System wurde eingeführt, nachdem George Washington seinen Rücktritt am Ende seiner zweiten Amtszeit angekündigt hatte, als die Demokratisch-Republikanische Partei und die Föderalistische Partei anfingen, Wahlen auf parteiischer Basis anzufechten. Möglicherweise haben beide Parteien 1796 informelle Versammlungen abgehalten, um über ihre Kandidaten zu entscheiden. Nach der unorganisierten Wahl von 1796 hielten beide Parteien 1800 formelle Caucuses ab, in denen ihre jeweiligen Präsidentschaftskandidaten ausgewählt wurden (vor der Ratifizierung des 12. Verfassungszusatzes im Jahr 1804 kandidierte jede Partei für zwei Präsidentschaftskandidaten). Die Föderalisten hielten Anfang Mai heimlich ihren Caucus ab, machten aber später ihre Wahl von Präsident John Adams und Charles Cotesworth Pinckney öffentlich. Die demokratisch-Republikaner trafen sich auch heimlich im Mai und stimmten zu, Thomas Jefferson und Aaron Burr gleichermaßen für den Präsidenten zu unterstützen. Die Föderalisten hielten nach 1800 keinen weiteren Caucus ab.
Im Jahr 1804, nach der Verabschiedung des 12. In einer Abstimmung des Caucus besiegte George Clinton John Breckinridge und wurde als Jeffersons Running Mate nominiert. Beim Caucus 1808 besiegten Anhänger von James Madison Versuche, Clinton oder James Monroe anstelle von Madison zu nominieren. Clinton wurde als Vizepräsidentschaftskandidatin nominiert, aber Clinton kritisierte die Legitimität des Caucus-Systems und sowohl Clinton als auch Monroe überlegten, für den Präsidenten zu kandidieren. Die Föderalisten hielten 1808 in New York einen proto-nationalen Kongress ab, auf dem sie Charles Cotesworth Pinckney und Rufus King nominierten. Im Jahr 1812 gewann Madison einstimmig die Wiedernominierung durch den Caucus. Die demokratisch-republikanischen Mitglieder der New Yorker Legislative verurteilten das Caucus-System jedoch als illegitim und nominierten stattdessen DeWitt Clinton, den Neffen von George Clinton. Die Föderalisten hielten 1812 eine weitere Proto-Convention ab, auf der sie sich bereit erklärten, Clinton zu unterstützen. Clinton verlor schließlich die Wahl, stellte Madison jedoch eine starke Herausforderung dar und gewann 89 Wahlstimmen.
1816 gewann James Monroe knapp die Nominierung seiner Partei gegen William H. Crawford. Anstatt das Caucus-Ergebnis anzufechten, Crawford unterstützte Monroes Kandidatur und beschloss, seine Zeit bis zu einer zukünftigen Wahl abzuwarten. Ein weiterer demokratisch-republikanischer Caucus traf sich 1820, vertagte sich jedoch ohne Nominierung. Monroes Wiederwahlkampagne von 1820 verlief ohne Widerstand, da die Föderalisten auf nationaler Ebene extrem schwach geworden waren und kein demokratisch-republikanischer Kandidat Monroe herausforderte, was Monroe zum einzigen Präsidentschaftskandidaten seit Washington machte, der ohne ernsthafte Opposition wiedergewählt worden war. 1824 wurde Crawford vom Caucus nominiert, aber auch drei andere demokratisch-republikanische Kandidaten kandidierten für das Präsidentenamt, von denen einer, John Quincy Adams, die Wahl gewann. Nach 1824 zerbrach die demokratisch-republikanische Partei zwischen Anhängern von Andrew Jackson und Anhängern von Adams; beide Kandidaten verurteilten das Caucus-System, und 1828 fand kein Caucus statt. Ab 1831 wurde der Congressional Nominating Caucus durch National Presidential Nominating Conventions ersetzt.
Die Föderalisten und Demokratischen Republikaner des frühen 19.Jahrhunderts waren auf staatlicher und insbesondere auf Bundesebene nicht so organisiert wie spätere Parteien, so dass die Mitglieder des Kongresses die einzige Gruppe nationaler Parteifunktionäre waren, die sich regelmäßig trafen. Viele kritisierten das Caucus-System als illegitim, da es in der Verfassung nicht erwähnt wurde. Der Caucus wurde auch Gegenstand innerparteilicher Kämpfe, insbesondere 1808, als Gegner von Madison seine Auswahl anprangerten. Das Caucus-System erzeugte Bedenken hinsichtlich der Gewaltenteilung, da Mitglieder der Legislative den Leiter der Exekutive nominierten. Die Bedeutung der Wiedernominierung könnte Madison im Vorfeld des Krieges von 1812 zu einer aggressiveren Haltung gedrängt haben. Viele Kritiker des Caucus-Systems schlugen vor, dass die Staaten die Hauptrolle bei der Nominierung von Kandidaten spielen sollten. Befürworter des Caucus-Systems argumentierten jedoch, dass es das beste System für die Auswahl nationaler Kandidaten in einem Land mit mehreren Staaten sei.
