Die drei großen Kami sind Daikokuten, Ebisu und Taira no Masakado. Da Daikokuten und Ebisu beide zu den sieben Glücksgöttern gehören, ist der Kanda-Schrein ein beliebter Ort für Geschäftsleute und Unternehmer, um für Wohlstand und Wohlstand zu beten.
Taira no Masakado war ein landbesitzender Regierungsbeamter, der einen massiven Aufstand gegen die Heian-Regierung anführte und sich selbst zum „Neuen Kaiser“ erklärte. Er wurde später aus einer Mischung von Angst und Ehrfurcht zum Status eines lokalen Kami erhoben. Er ist eine wichtige Figur in der Geschichte des Schreins. Nach seiner Niederlage im Jahr 940 n. Chr. wurde er von Fujiwara no Hidesato enthauptet und sein abgetrennter Kopf in einem Holzeimer (首桶) in die Gegend von Shibasaki (Edo) gebracht und auf einem niedrigen Hügel in der Nähe des heutigen Schreins begraben. Einheimische, die seinen Trotz respektierten und seinen Fluch fürchteten, verankerten ihn im Kanda-Schrein, und sein Geist soll über die Umgebung wachen. Es wurde gemunkelt, dass Masakados wütender Geist, als sein Schrein verfiel, Naturkatastrophen und Plagen in den nahe gelegenen Ländern verursachte. Es wird auch gesagt, dass Tokugawa Ieyasu sich unwohl fühlte, sein Schloss in der Nähe eines so mächtigen Geistes bauen zu lassen, und beschloss daher, den Kanda-Schrein an seinen modernen Standort zu verlegen.
Während der Meiji-Zeit stand Kaiser Meiji unter öffentlichem Druck, den Kanda-Schrein in die Tokyo Ten Shrines (東京十社, Tokyo Jissha) aufzunehmen, zögerte jedoch aufgrund der Verbindung des Schreins mit Taira no Masakado, der als gefährlicher regierungsfeindlicher Demagoge angesehen wurde. Dies wurde vorübergehend behoben, indem Taira no Masakado als verankertes Kami entfernt wurde. Masakados Geist erwies sich jedoch bei den Bürgern als so beliebt, dass er nach dem Zweiten Weltkrieg symbolisch an den Schrein zurückgegeben wurde.
