In den 1980er Jahren erkrankten zwei Besucher der Höhle an dem Marburg-Virus. 1980 starb ein Franzose nach dem Besuch der Höhle an dem Virus, und 1987 erkrankte auch ein 15-jähriger dänischer Junge und starb nach dem Besuch der Höhle. Zwei Stämme des Virus wurden aus diesen Infektionen katalogisiert: Der Stamm von 1980 ist nach einem Arzt, Shem Musoke, benannt, der die Infektion durch den französischen Patienten überlebte; Der Stamm von 1987 heißt Ravn, nach dem Nachnamen des dänischen Patienten. Basierend auf diesen Fällen wurde vom United States Army Medical Research Institute of Infectious Disease (USAMRIID) eine Expedition durchgeführt, um die vermutlich in der Höhle lebenden Vektorarten zu identifizieren. Trotz Probenahme einer Vielzahl von Arten (einschließlich Fruchtfledermäuse) wurde kein Marburg gefunden und der Tiervektor blieb ein Rätsel. Diese Ereignisse wurden von Richard Preston in dem Bestseller The Hot Zone (1994) dramatisiert.
Im September 2007 fanden ähnliche Expeditionen zu aktiven Minen in Gabun und Uganda solide Beweise für Marburg-Reservoirs in höhlenbewohnenden ägyptischen Fruchtfledermäusen. Die ugandischen Minen hatten beide Kolonien derselben Art afrikanischer Fruchtfledermäuse, die die Kitum-Höhle besiedeln, was darauf hindeutet, dass der lang gesuchte Vektor in Kitum tatsächlich die Fledermäuse und ihr Guano waren. Die Studie wurde durchgeführt, nachdem zwei Minenarbeiter im August 2007 Marburg erkrankt waren, beide ohne von Fledermäusen gebissen zu werden, was darauf hindeutet, dass sich das Virus durch Einatmen von Guanopulver ausbreiten könnte.
