Die traditionelle Klassifikation hat den einzelligen Eukaryoten oder Protisten eine Einteilung in pflanzenähnliche und tierähnliche Formen auferlegt; In einer aktuellen Ansicht sind die Protisten eine vielfältige Ansammlung von Pflanzen-, Tier- und pilzartigen Gruppen. Die Klassifizierung dieser in Phyla ist aufgrund ihrer relativ einfachen Struktur und begrenzten geologischen Aufzeichnung schwierig, Die Untersuchung der Ultrastruktur und anderer Merkmale liefert jedoch neue Einblicke in die protistische Klassifizierung. Mögliche Klassifikationen werden diskutiert, und eine zusammenfassende Klassifizierung der lebenden Welt in Königreiche (Monera, Protista, Pilze, Animalia, Plantae) und Phyla wird vorgeschlagen. Diese Klassifizierung legt auch nahe, Gruppierungen von Phyla in Superphyla und Form-Superphyla, und ein verbreitertes Reich Protista (einschließlich Grünalgen, oomycotes und Schleimpilze, aber ohne Rot- und Braunalgen). Die Klassifikation versucht daher, einen Kompromiss zwischen den protistischen und protoctistischen Königreichen von Whittaker und Margulis anzubieten und eine vollständige Auflistung der Phyla mit der Gruppierung dieser für die synoptische Behandlung zu kombinieren.
