Tuvo una pelea famosa y de larga data con el ex senador Vince Fumo. El sitio web político PoliticsPA comparó la relación con el feudo Hatfield-McCoy Durante las primarias demócratas de 2008 para el 1er distrito senatorial en el Senado de Pensilvania en Filadelfia, Dougherty recibió una sorprendente derrota por Larry Farnese, que fue fuertemente apoyado por Fumo. Después de la concesión de Dougherty, Fumo fue escuchado coreando » ¡Doc está muerto! Doc está muerto!»
En 2003, fue nombrado en la lista de personas políticamente influyentes de Pensilvania «Power 50» de PoliticsPA. En 2003, fue incluido en la lista «Power 75» de Pennsylvania Report. En 2010, la revista Politics lo nombró uno de los demócratas más influyentes de Pensilvania.
En 2015, apoyó al ex concejal de la Ciudad de Filadelfia Jim Kenney para Alcalde de Filadelfia. Su apoyo fue un factor impulsor en su victoria en una concurrida primaria demócrata.
En enero de 2019, Dougherty fue acusado en una investigación Local 98 de IBEW que lo acusaba de mal uso de fondos sindicales para beneficio personal, entre muchas acusaciones. Su defensa ha argumentado enérgicamente que las supuestas actividades en marzo eran de hecho lícitas. El caso se ha vuelto bastante complicado, con algunos acusados pidiendo que el caso se divida entre diferentes cuestiones controvertidas, en julio.