Khama es probablemente más recordado por haber tomado tres decisiones cruciales durante su mandato como jefe. En primer lugar, aunque abolió la ceremonia de bogwera en sí, Khama retuvo los regimientos de mephato como fuente de trabajo gratuito para una variedad de propósitos económicos y religiosos. El alcance de las responsabilidades de trabajo de un mephato más tarde se expandiría considerablemente bajo el gobierno del hijo de Khama, Tshekedi, en la construcción de escuelas primarias, silos de grano, sistemas de red de agua e incluso una universidad llamada Moeng ubicada en las afueras de Serowe, que bajo el reinado de Khama se había convertido en la capital de Bamangwato. En colaboración con el mephato, Khama introdujo una serie de mejoras tecnológicas europeas en el territorio de Bamangwato, incluido el mogoma, o arado de vertedera tirado por bueyes (en lugar de la azada de mano) y vagones para el transporte (en lugar de trineos).
En el mundo de hoy, el mephato podría considerarse una forma explotadora de autoayuda comunitaria. Los hombres y mujeres de Bangwato estaban obligados a participar en los proyectos de trabajo asignados cuando sus regimientos eran llamados al servicio. Y fueron llamados, en el sentido literal de la palabra. Una persona designada del pueblo subía a la cima de la colina Serowe y gritaba literalmente el nombre del mephato que estaba programado para comenzar a trabajar. Todos los miembros del mephato dejaban de hacer lo que estaban haciendo y comenzaban su período de servicio de seis meses, sin ningún apoyo material de la aldea (en particular, sin ninguna contribución organizada de alimentos). En general, se esperaba que el mephato se valiera por sí mismo durante su asignación de trabajo.
Después de que Khama se convirtiera en rey en 1875, después de derrocar a su padre Sekgoma y codear a su hermano Kgamane, su ascensión llegó en un momento de grandes peligros y oportunidades. Incursiones Ndebele desde el norte (desde lo que ahora es Zimbabue), excursionistas bóer y «mixtos» desde el sur, y fuerzas alemanas desde el Oeste, todos con la esperanza de apoderarse de su territorio y sus tierras interiores. Respondió a estos desafíos alineando su estado con los objetivos administrativos de los británicos, que le proporcionaron cobertura y apoyo, y, en relación, expandiendo enérgicamente su propio control sobre un área mucho más amplia que cualquier «kgosi» antes que él. Khama se convirtió al cristianismo, lo que lo llevó a criminalizar el sectarismo y a desaprobar las instituciones favorecidas por los tradicionalistas. A petición de Khama, se aprobaron leyes estrictas contra la importación de alcohol. Para hacer cumplir la prohibición del alcohol, los blancos fueron desterrados de su reino.
El propio gobierno británico tenía dos ideas sobre qué hacer con el territorio. Una facción, apoyada por un misionero local llamado John Mackenzie, abogó por el establecimiento de un protectorado, mientras que otra facción, encabezada por Cecil Rhodes, adoptó una postura más firme y exigió que el país se abriera al asentamiento europeo y la explotación económica. La resolución llegó en 1885, cuando el territorio al sur del río Molopo se convirtió en la colonia de Bechuanalandia británica, mientras que el territorio al norte del río se convirtió en el Protectorado de Bechuanalandia. La colonia fue finalmente incorporada a la Colonia británica del Cabo y ahora es parte de Sudáfrica.
Rhodes continuó su campaña para presionar a su gobierno para anexar lo que quedaba del territorio de Khama. En 1895, con otros dos jefes de tribus vecinas, Bathoen I y Sebele I, Khama viajó a Gran Bretaña para presionar a la Reina para que la protegiera de las presiones duales de la Compañía Británica de Sudáfrica de Cecil Rhodes, ubicada en lo que más tarde se convertiría en Rodesia al norte, y de los colonos afrikáners que se arrastraban desde el sur. Debido a que el viaje fue organizado por misioneros, el cristianismo de Khama se convirtió en la pieza central de la campaña. Los Jefes viajaron ampliamente a través de Gran Bretaña hablando a grandes audiencias evangélicas. No solo se escribió la biografía de Khama en este momento, sino que recibió grandes cantidades de otra prensa que consolidó su leyenda como cristiano africano. El viaje a Gran Bretaña de los tres reyes tswana finalmente resultó exitoso después de la desafortunada incursión de Jameson de 1896, cuando la reputación de Rhodes se arruinó. Si Khama y sus compatriotas no hubieran podido convencer a las autoridades británicas de la necesidad de proteger al Bamangwato antes del fiasco de la Incursión de Jameson, es muy probable que gran parte de lo que hoy es Botsuana hubiera sido absorbida por Rodesia y Sudáfrica.
Khama III fue firme en imponer su voluntad cristianizada a la tribu. Promovió escuelas y dio preferencia a la contratación de cristianos educados. Prohibió el alcohol de las tierras tribales (con éxito variable), impuso moratorias a la venta de ganado fuera del territorio de Bamangwato y las tierras tribales como concesiones a intereses mineros y ganaderos extranjeros, y abolió la poligamia. La abolición de la poligamia fue quizás su más controversial. Algunos argumentan que a medida que el cristianismo se extendió más tarde entre las otras tribus del protectorado y la poligamia fue abolida universalmente, el «pegamento» social que mantenía unidas a las familias (extendido como lo estaban a través de la poligamia) se secó.
