Cuando se convocó la Segunda Duma el 20 de febrero de 1907, los kadetes se encontraron en una posición difícil. Su liderazgo no estuvo representado en la Duma después del fiasco del Manifiesto de Viborg y su número se redujo a unos 100. Aunque seguía siendo la facción más grande de la Duma, ya no dominaban el parlamento y sus intentos de concentrarse en la elaboración de leyes se vieron frustrados por radicales de izquierda y derecha que veían a la Duma como una herramienta de propaganda. Aunque los kadetes habían moderado su posición en la Segunda Duma, se negaron a votar en mayo de 1907 por una resolución denunciando la violencia revolucionaria que dio al gobierno de Piotr Stolypin un pretexto para disolver la Segunda Duma el 3 de junio de 1907 y cambiar la ley electoral para limitar drásticamente la representación de partidos de izquierda y liberales.
Debido a los cambios en la ley electoral, los kadetes se redujeron a un grupo de oposición relativamente pequeño (54 escaños) en la Tercera Duma (1907-1912). Aunque excluidos de los comités más importantes de la Duma, los kadetes no eran del todo impotentes y podían determinar el resultado de ciertos votos cuando se aliaban con la facción octobrista centrista contra los diputados nacionalistas de derecha. Con la revolución aplastada en 1908, moderaron aún más su posición al votar para denunciar la violencia revolucionaria, ya no buscaron la confrontación con el gobierno y se concentraron en influir en la legislación siempre que fue posible. En 1909, Miliukov podía afirmar que los kadetes eran ahora «la oposición de Su Majestad, no la oposición a Su Majestad», lo que solo causó un desacuerdo moderado entre la facción de izquierda del partido.
Aunque los kadetes, aliados con la facción Progresista y los octobristas, fueron capaces de impulsar algunos proyectos de ley liberales (libertades religiosas, libertad de prensa y de los sindicatos) a través de la Duma, los proyectos de ley fueron diluidos por la cámara alta del parlamento o vetados por el zar. El fracaso de su programa legislativo desacreditó aún más la estrategia de cambio pacífico de los kadetes a través de una reforma gradual.
En 1910, el gobierno reavivó su campaña de rusificación prerrevolucionaria en un intento de restringir los derechos de las minorías, reduciendo drásticamente la autonomía de Finlandia. La mayoría de los kadetes se opusieron a estas políticas y se aliaron con el ala izquierda de los octobristas para tratar de aplastarlas tanto como fuera posible, pero no tuvieron éxito. Sin embargo, una minoría de kadetes encabezados por Piotr Struve apoyaron una versión moderada de la rusificación, que amenazó con dividir el partido. Con el aumento del descontento popular después de la masacre de Lena el 4 de abril de 1912 y una disminución continua en la membresía del partido después de 1906, la ruptura en el partido se hizo más pronunciada. Los líderes kadetes de la izquierda, como el miembro del Comité Central Nikolai Vissarionovich Nekrasov, argumentaron que la experiencia de la Duma había sido un fracaso y que el «trabajo constructivo» no tenía sentido bajo un gobierno autocrático. Los líderes kadetes de la derecha, como los miembros del Comité Central Vasily Maklakov, Mijaíl Chelnokov, Nikolai Gredeskul y Ariadna Tyrkova-Williams, abogaron por un giro a la derecha. Los desacuerdos se dejaron de lado temporalmente en julio de 1914 al estallar la Primera Guerra Mundial, cuando los kadetes apoyaron incondicionalmente al gobierno y encontraron una salida para sus energías en varios tipos de trabajo de socorro bajo el paraguas de la Unión Panrusa de Zemstvos y la Unión Panrusa de Ciudades.
Una vez que el estallido inicial de sentimientos de unidad nacional se calmó a mediados de 1915, cuando la retirada rusa de Galicia mostró la incompetencia del gobierno, los kadetes, junto con la facción Progresista, la facción octobrista y una parte de la facción nacionalista en la Duma, formaron el Bloque Progresista en agosto de 1915, que era crítico con la prosecución de la guerra por el gobierno y exigía un gobierno de «confianza popular». A medida que las derrotas de Rusia en la guerra se multiplicaron, la oposición de los kadetes se hizo más pronunciada, culminando con el discurso de Miliukov en la Duma en octubre de 1916, cuando casi acusó a los ministros del gobierno de traición.