Los tres kami principales consagrados son Daikokuten, Ebisu y Taira no Masakado. Como Daikokuten y Ebisu pertenecen a los Siete Dioses de la Fortuna, el Santuario de Kanda es un lugar popular para hombres de negocios y empresarios para orar por riqueza y prosperidad.
Taira no Masakado fue un funcionario del gobierno propietario de tierras que dirigió una insurrección masiva contra el gobierno Heian y se declaró el «Nuevo Emperador» (新皇). Más tarde fue elevado al estatus de kami local por una mezcla de miedo y reverencia. Es una figura importante en la historia del santuario. Después de su derrota en el año 940 d.C., fue decapitado por Fujiwara no Hidesato y su cabeza cortada fue llevada a la zona de Shibasaki (Edo) en un cubo de madera (首桶) y enterrada en una colina baja cerca de la ubicación actual del santuario. Los lugareños que respetaban su desafío, y temían su maldición, lo consagraron en el Santuario de Kanda, y se dice que su espíritu vela por las áreas circundantes. Se rumoreaba que cuando su santuario cayó en mal estado, el espíritu enojado de Masakado provocó desastres naturales y plagas en las tierras cercanas. También se dice que Tokugawa Ieyasu se sintió incómodo al tener su castillo construido cerca de un espíritu tan poderoso, por lo que decidió trasladar el Santuario de Kanda a su ubicación moderna.
Durante el período Meiji, el emperador Meiji se enfrentó a la presión pública para incluir el Santuario Kanda en los Santuarios de los Diez de Tokio (社社, Tokyo Jissha), pero dudó en hacerlo debido a la asociación del santuario con Taira no Masakado, que era visto como un peligroso demagogo antigubernamental. Esto se resolvió temporalmente eliminando a Taira no Masakado como un kami consagrado. Sin embargo, el espíritu de Masakado resultó tan popular entre los plebeyos, que fue devuelto simbólicamente al santuario después de la Segunda Guerra Mundial.
