Haplogroup L2 (mtDNA)

L2: lla on viisi pääasiallista alaluokkaa: L2a, L2b, L2c, L2d ja L2e. näistä alalajeista yleisin alaluokka on L2A, jota esiintyy sekä Afrikassa että Levantissa.

Haploryhmää L2 on havaittu Sudanin Kulubnartissa sijaitsevan saaren hautausmaan yksilöistä, jotka ovat peräisin varhaiskristilliseltä kaudelta (550-800).

Haploryhmä L2aEdit

L2a on laajalle levinnyt Afrikassa ja yleisin ja laajimmalle levinnyt Saharan eteläpuolisen Afrikan Haploryhmä, ja sitä esiintyy jonkin verran myös 19% Amerikoissa afrikkalaisten jälkeläisten keskuudessa (Salas et al., 2002). L2a: lla on mahdollinen Alkuperämaa n. 48 000 YBP.

sitä esiintyy erityisen runsaasti Tšadissa (38% otoksesta; 33% eriyttämätön L2 keskuudessa Tšad Arabit,), ja ei-Bantu populaatioiden Itä-Afrikassa (Kenia, Uganda Ja Tansania) 38%. Mosambikissa noin 33% ja Ghanassa 32%.

tälle alaluokalle ovat ominaisia mutaatiot at 2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 ja 16294. Se edustaa 52% Koko L2 ja on ainoa alaluokka L2 on levinnyt kaikkialla Afrikassa.

L2a: n laaja levinneisyys ja monimuotoisuus vaikeuttaa maantieteellisen alkuperän tunnistamista. Tärkein palapeli on lähes kaikkialla oleva Haploryhmä L2a,joka on saattanut levitä itään ja länteen Sahelin käytävää pitkin Pohjois-Afrikassa viimeisen jääkauden maksimin jälkeen, tai näiden laajentumisten alkuperä voi olla aikaisemmin, myöhemmän kivikauden alussa ∼ 40 000 vuotta sitten.

Itä-Afrikassa L2a: ta löydettiin 15% Niilin laakso-Nubiasta, 5% egyptiläisistä, 14% Cushilaisista puhujista, 15% Seemiläisistä Amharoista, 10% Guragesta, 6% Tigray-Tigrinya-kansasta, 13% etiopialaisista ja 5% jemeniläisistä.

Haploryhmä L2a esiintyy myös Pohjois-Afrikassa, eniten 20% tuaregeja, Fulaneja (14%). Löytyy myös joidenkin Algerian arabien, se löytyy 10% Marokon arabien, jotkut Marokon berberit ja Tunisian berberit. (watson 1997) et al., (vigilant 1991) et al. 1991.

potilailla, joille annetaan STAVUDIINIA HIV: n hoitoon, Haplogroup L2a-ryhmään liittyy sivuvaikutuksena pienempi perifeerisen neuropatian todennäköisyys.

Haploryhmä L2a1Edit

L2a voidaan jakaa edelleen l2a1: een, jolloin siirrytään 16309: ään (Salas et al. 2002).

tätä alaluokkaa on havaittu vaihtelevasti Länsi-Afrikassa malinkien, Wolofien ja muiden keskuudessa; Pohjoisafrikkalaisten keskuudessa;Sahelissa hausojen, Fulbien ja muiden keskuudessa; Keski-Afrikassa Bamileken, Falin ja muiden keskuudessa; Etelä-Afrikassa Khoisanien heimon keskuudessa, mukaan lukien Khwen ja Bantun puhujat; ja Itä-Afrikassa Kenian kikuyujen keskuudessa.

kaikki Etiopiassa esiintyvät L2-kladit ovat pääosin peräisin kahdesta alaluokasta, L2a1: stä ja L2b: stä. L2a1 on määritelty mutaatioilla 12693, 15784 ja 16309. Useimmat etiopialaiset L2a1-sekvenssit jakavat mutaatiot NPS 16189: ssä ja 16309: ssä. Kuitenkin, kun suurin osa (26 pois 33) afroamerikkalaiset jakaa Haplogroup L2a täydellinen sekvenssit voitaisiin jakaa neljään alaluokkaan substitutions at nps L2a1e-3495, L2a1a-3918, L2a1f-5581, ja L2a1i-15229. Mitään näistä sekvensseistä ei havaittu Etiopian 16309 L2a1-näytteessä. (Salas 2002) et al.

Haploryhmää L2a1 on havaittu myös Mahralla (4, 6%).

Haploryhmästä L2a1 on löydetty muinaisia fossiileja, jotka liittyvät Esikeraamiselle neoliittiselle kulttuurille tell Hallasta Syyriasta. Tansanian Luxmandassa sijaitsevalta Savannipaimenen neoliittiselta paikalta kaivettu yksilö kantoi myös L2a1-kladia. Admixture clustering analyysi osoitti edelleen, että yksilö kantoi merkittäviä syntyperä antiikin Levant, vahvistaa esi-siteitä päättäjien savanni pastoraalinen neoliittinen ja Pre-keramiikka neoliittinen.

Haploryhmä L2a1aEdit

alaluokka L2a1a määritellään substituutioilla 3918, 5285, 15244 ja 15629. On olemassa kaksi L2A klustereita, jotka ovat hyvin edustettuina Kaakkois-Afrikassa, L2a1a ja L2a1b, molemmat määritellään siirtymät melko vakaa HVS-I kantoja. Nämä molemmat näyttävät olevan peräisin Länsi-Afrikasta tai Luoteis-Afrikasta (kuten samanlaisten tai naapurityyppien levinneisyys osoittaa), ja ne ovat laajentuneet dramaattisesti joko Kaakkois-Afrikassa tai väestössä, joka on lähtöisin nykyisistä Kaakkoisafrikkalaisista.

aivan viimeaikaiset tähtipurkaukset alaluokilla L2a1a ja L2a2 viittaavat bantujen laajennusten allekirjoitukseen, kuten myös Pereira ym. ovat ehdottaneet. (2001).

L2a1a on määritelty mutaatiolla 16286. L2a1a: n perustajaehdokas ajoittuu 2 700 (SE 1 200) vuoden taakse. (Pereira et al. 2001). Kuitenkin L2a1a, sellaisena kuin se on määritelty substituutiolla at (np 16286) (Salas et al. 2002), jota nyt tukee koodausalueen merkki (np 3918) (kuva. 2A) ja löytyi neljästä kuudesta jemeniläisestä L2a1-sukulinjasta. L2a1a esiintyy korkeimmillaan Kaakkois-Afrikassa (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). Sekä usein perustaja haplotyyppi ja johdettu lineages (kanssa 16092 mutaatio) löytyy keskuudessa jemeniläiset ovat tarkkoja matches sisällä Mosambikin sekvenssit (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). L2a1a esiintyy pienemmällä yleisyydellä myös Luoteis-Afrikassa Malin ja Mauritanian Maure-ja Bambara-vuoristossa. (Rando et al. 1998; Maca-Meyer ym. 2003)

Haploryhmä L2a1a1Edit

L2a1a1 määritellään markkereilla 6152C, 15391t, 16368c

Haploryhmä L2a1bEdit

L2a1b määritellään substituutioilla 16189 ja 10143. 16192 on yleinen myös l2a1b: ssä ja L2a1c: ssä; se esiintyy Pohjois-Afrikassa Egyptissä, se esiintyy myös Kaakkois-Afrikassa, joten se voi olla myös merkki bantujen laajenemisesta.

Haploryhmä L2a1cEdit

L2a1c jakaa usein mutaation 16189 L2a1b: n kanssa, mutta sillä on omat merkkinsä kohdissa 3010 ja 6663. 16192 on myös yleinen l2a1b ja L2a1c; se esiintyy Kaakkois-Afrikassa sekä Itä-Afrikassa. Tämä viittaa siihen, että tämä kladi on jossain määrin monipuolistunut paikan päällä.

kohdat T16209C C16301T C16354T l2a1: n päällä määrittelevät pienen alakladin, jonka Kivisild et al. (2004, kaavio 3) (ks. myös kuvio 6, Salas et al. 2002), joka esiintyy pääasiassa Itä-Afrikassa (esimerkiksi Sudan, Nubia, Etiopia), turkanassa ja Länsi-Afrikassa (esimerkiksi Kanuri).

Tšadin altaassa tunnistettiin neljä eri L2a1c-tyyppiä yksi tai kaksi mutaatiovaihetta Itä-ja länsiafrikkalaisista tyypeistä. (Kivisild et al.) 2004. (lainaus sivulla.9 tai 443)

Haploryhmä L2a1c1Edit

L2a1c1 on pohjoisafrikkalaista alkuperää. Se määritellään markkereilla 198, 930, 3308, 8604, 16086. Sitä tavataan Tunisiassa Sefardeilla, Aškenazeilla, juutalaisilla, Heprealaisilla, marokkolaisilla, egyptiläisillä, Nubialaisilla ja Jemeniläisillä.

Haploryhmä L2a1f

Khosian, Sambia, Madagaskar

Haploryhmä L2a1kEdit

L2a1k on määritelty markkereilla G6722A ja T12903C. se on aiemmin kuvattu eurooppalaisittain omaksi alaluokakseen l2a1a ja havaittu Tšekissä ja Slovakiassa.

Haploryhmä L2a1l2aEdit

L2a1l2a on tunnustettu ”Aškenazi-ominaiseksi” haploryhmäksi, joka nähdään Aškenazi-juutalaisten keskuudessa, joilla on sukujuuria Keski-ja Itä-Euroopassa. Sitä on havaittu pieniä määriä myös näennäisesti ei-juutalaisissa puolalaisväestöissä, joissa sen oletetaan olevan peräisin Aškenazi-sekoituksesta. Kuitenkin, tämä haplotyyppi muodostaa vain hyvin pieni osa Ashkenazi mitokondrion lineages; eri tutkimukset (mukaan lukien Behar n) ovat asettaneet sen esiintyvyys välillä 1,4–1,6%.

Haploryhmä L2a2Edit

L2a2 on Mbuti-Pygmeille ominainen.

Haploryhmä L2b ’Cedit

L2b’ C kehittyi todennäköisesti noin 62 000 vuotta sitten.

Haploryhmä L2bEdit

tätä alaluokkaa tavataan pääasiassa Länsi-Afrikassa, mutta se on levinnyt koko Afrikkaan.

Haploryhmä L2cEdit

L2c esiintyy useimmin Länsi-Afrikassa, ja on saattanut syntyä siellä. Erityisesti esiintyy Senegalissa 39%, Kap Verdessä 16% Ja Guinea-Bissaussa 16%.

Haploryhmä L2dEdit

L2d esiintyy useimmin Länsi-Afrikassa, jossa se on saattanut syntyä. Sitä tavataan myös Jemenissä, Mosambikissa ja Sudanissa.

Haploryhmä L2eEdit

L2e (entinen L2d2) on tyypillinen Länsi-Afrikassa. Sitä tavataan myös Tunisiassa sekä Guinea-Bissaun Mandinkojen ja afroamerikkalaisten keskuudessa.