The Jerusalem Biblical Zoo perustettiin vuonna 1928 pieneksi lasten eläintarhaksi Harav Kook Streetille Keski-Jerusalemiin. Eläintarhan perusti edesmennyt professori Aharon Shulov, yksi heprealaisen yliopiston eläintieteen pioneereista. Vuonna 1941 Shmu ’ El Hanavi-kadulle perustettiin hieman suurempi eläintarha ja vuonna 1947 eläintarha siirrettiin Mt. Scopoksen, jossa heprealaisella yliopistolla oli maata varattuna sitä varten. Vapaussodan (1948) aikana suurin osa 300 eläimestä kuoli kranaattituleen tai kuoli karattuaan häkeistään. Kun sota päättyi ja eläintarha oli Jordanian armeijan käsissä, jordanialaiset suostuivat evakuoimaan eloonjääneet kaksikymmentä eläintä uuteen paikkaan Givat Komunaan, romeman läheisyyteen. Eläintarha pysyi siellä vuodesta 1950 vuoteen 1991, jona aikana siitä kehittyi tunnettu ja rakastettu nähtävyys. Eläintarha suljettiin vuonna 1991 aloittaakseen muuttamisen uuteen sijaintiinsa ja uudelleen avaamisen nimellä Tisch Family Zoological Gardens in Jerusalem-the Biblical Zoo, joka vihittiin vuonna 1993 Malchassa.
