John Sulston (1942-2018)

John Sulston

John Sulston.Luotto: Scott Barbour/Getty

periaate, jonka mukaan genomitietoja pitäisi jakaa yleisesti ilman kaupallista osallistumista, on suurelta osin John Sulstonin laajalti hyväksymä. Kansainvälisen Human Genome Projectin brittiläisen panoksen johtajana Sulston sai rahoittajat ja kollegat vakuuttuneiksi siitä, miten tärkeää on saada täydellinen, laadukas sekvenssi vapaasti maailmanlaajuisen tiedeyhteisön saataville. Hänen sitoutumisensa perustui moraaliseen varmuuteen siitä, että voitolla motiivina ei ollut sijaa tieteessä.

vuonna 2002 hän jakoi Nobelin fysiologian tai lääketieteen palkinnon ansiostaan sen ymmärtämisessä, miten geenit säätelevät kehittyvän suolinkaisen Caenorhabditis elegansin solujen kohtaloa. Madon solulinjaa ja myöhemmin perimän sekvensointia käsittelevässä työssään Sulston edisti ajatusta, että laajamittaiseen tiedonkeruuseen ilman erityistä hypoteesia sijoittamisella on pitkäaikaisia hyötyjä.

Sulston, joka kuoli 6. maaliskuuta, oli englantilaisen papin ja opettajan poika. Hän suhtautui vakavasti vanhempiensa välinpitämättömyyteen aineellista varallisuutta kohtaan ja heidän haluunsa työskennellä yhteisen hyvän hyväksi. Mekaniikka kiehtoi häntä jo varhain, ja leikellessään kuolleita eläimiä hän alkoi nähdä myös eläviä olentoja koneina. Hän sai stipendin opiskelemaan luonnontieteitä Cambridgen yliopistoon Britanniaan.

hänen väitöskirjansa käsitteli myös Cambridgessa oligonukleotidien synteesiä — nukleiinihappojen kuten DNA: n ja RNA: n rakennusaineita. Hänen hohtonsa kokeilijana varmisti hänelle paikan postdoc orgaanisen kemistin Leslie Orgelin kanssa Salk Institute for Biological Studiesissa La Jollassa, Kaliforniassa, tutkien elämän alkuperää. Sulston saapui vuonna 1966 tutkimaan nukleiinihappojen replikaatiota, ja hän ymmärsi ensimmäistä kertaa kemian työnsä evolutiivisen kontekstin.

sielläkin Sulston tapasi Francis Crickin, joka oli mukana löytämässä DNA: n kaksoiskierteen; Crick suositteli häntä tehtävään lääketieteellisen tutkimusneuvoston molekyylibiologian laboratorioon Cambridgeen. Vuonna 1969 Sulston liittyi pieneen ryhmään, jota johti geneetikko Sydney Brenner. Etsiessään malliorganismia, jossa tutkia geenien vuorovaikutusta, kehitystä ja käyttäytymistä, Brenner valitsi C. elegansin. Pikkuruisella matolla on aikuisena vain 959 solua, mutta silti sillä on suolisto, hermosto, sukurauhaset ja lukuisia käyttäytymismalleja liikkua, ruokkia ja lisääntyä.

se on myös läpinäkyvä. Sulston käytti nomarskin differentiaali-interferenssikontrastimikroskooppia visualisoidakseen solujen tumia elävissä matojen toukissa ja myöhemmin haastavammissa alkioissa. Hän havaitsi ja kirjasi invariant järjestyksessä solunjakautumia, jotka rakentavat aikuisen mato. Hänen työnsä loi pohjan tuleville matobiologeille vastata kehitykseen liittyviin kysymyksiin, joilla on vaikutuksia muihin lajeihin, myös meidän lajeihimme.

Sulston huomasi, että tietyt solut eliminoituvat kehityksen aikana. Hän alkoi tutkia prosessin genetiikkaa yhdysvaltalaisen postdoc Robert Horvitzin kanssa. Palattuaan kotiin Massachusetts Institute of Technologyyn Cambridgeen Horvitz löysi geenejä, jotka säätelevät ohjelmoitua solukuolemaa. Myöhemmin näiden geenien mutaatiot osoittautuivat ratkaiseviksi syöpäsolujen hallitsemattoman lisääntymisen ymmärtämisessä. Sulston, Horvitz ja Brenner jakoivat vuoden 2002 Nobelin palkinnon ”löytöistään, jotka koskevat elinten kehityksen geneettistä säätelyä ja ohjelmoitua solukuolemaa”.

vuodesta 1983 lähtien Sulston ryhtyi kartoittamaan ja sekvensoimaan madon 100 miljoonan emäsparin genomia. Hänen laboratorionsa työskenteli yhteistyössä ja ystävällisessä kilpailussa Robert Waterstonin kanssa, joka oli tuolloin Washingtonin yliopistossa St. Louisissa. Vuonna 1989 heidän yhteinen voimansa motivoi Jim Watsonia, silloista Human Genome Projectin johtajaa, rahoittamaan heidän pilottijaksotushankettaan. Matoprojekti osoitti, että ihmisen perimän automatisoitu, suuritehoinen sekvensointi ei ollut mahdotonta. Vuonna 1992 Brittiläinen Wellcome Trust kutsui Sulstonin johtamaan uutta sekvensointilaitostaan, Sanger Centreä (nykyinen Sanger-instituutti) Hinxtonissa.

johtaessaan Sangeria osana kansainvälistä konsortiota Sulstonilla oli keskeinen rooli tietojen julkistamisen ja avoimen saatavuuden periaatteiden luomisessa. Kun vuonna 1998 Celera Genomicsin Craig Venterin johtama yksityinen aloite ilmoitti aikovansa sekvensoida ihmisen genomin ensin ja kaupallisen voiton saamiseksi, Sulston puolusti avoimen datan periaatetta. Hän tuli, Francis Collins – silloinen johtaja Yhdysvaltain National Human Genome Research Institute-johtava ääni taivutella sekä Yhdysvaltain National Institutes of Health ja Wellcome Trust sitoutumaan hankkeen loppuun. Ihmisen genomisekvenssi on 99.99% accuracy, julkaistiin Nature-lehdessä 21. lokakuuta 2004 (International Human Genome Sequencing Consortium Nature 431, 931-945; 2004).

kuten Sulston ennusti, koko ihmisen perimän saatavuus ajoi sekä akateemista että kaupallista tutkimusta maailmanlaajuisesti. Työ tuottaa hitaasti kliinisiä sovelluksia erityisesti syövän kaltaisilla alueilla, joissa geenimutaatiot määrittävät, onko kasvain herkkä hoidolle. Samaan aikaan teknologia on kehittynyt ja kustannukset laskeneet niin, että yksilöiden koko perimän sekvensointi saattaa olla pian rutiinia.

Sulston oli itse laboratoriossa valmistelemassa mato-klooni-kirjastoa kartoitusprojektia varten ja purkamassa varhaisten sekvensointikoneiden salausta, jotta sähköinen data voitiin analysoida suoraan. Hän kuitenkin arvosti aina yhteistyökumppaneita, joiden taidot poikkesivat hänen omastaan, ja johti Sangeria yhdessä seitsemän hengen laudalla. Kun hän pyysi minua kirjoittamaan kirjan ihmisen genomista, – hän vaati, että toimimme tasavertaisina kumppaneina.

ihmisjakson julkaisun jälkeen Sulston omistautui kirjoittamiselle ja puhumiselle avoimen saatavuuden puolesta ja laajemmin tieteen ja yhteiskunnan suhteesta. Lämmin ja sanavalmis hän voitti yleisön puolelleen nöyryydellään ja intohimollaan.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.