Väiteltyään tohtoriksi Dynan liittyi Yhdysvaltain keskuspankin makrotaloudellisen analyysin osastoon. Hän pysyi Yhdysvaltain keskuspankissa 17 vuotta, palvellen erilaisissa johtotehtävissä. Vuonna 1998 hänellä oli vierailutapaaminen Johns Hopkinsin yliopistossa. Vuosina 2003-2004 Dynan toimi Talousneuvonantajien neuvoston (Council of Economic Advisors) henkilökunnassa vanhempana ekonomistina Greg Mankiwin toimiessa puheenjohtajana. Vuonna 2009 hän jätti Yhdysvaltain keskuspankin siirtyäkseen Brookings Institutionin Taloustutkimuksen varatoimitusjohtajaksi. Vuonna 2013 hän sai nimekseen Robert S. Kerr Senior Fellow brookingsissa.
elokuussa 2013 presidentti Obama nimitti Dynanin talouspolitiikan apulaisministeriksi ja Yhdysvaltain valtiovarainministeriön pääekonomistiksi. Yhdysvaltain senaatti vahvisti hänet kesäkuussa 2014. Tässä tehtävässä hän neuvoi valtiovarainministeriä Yhdysvaltain tämänhetkisestä ja tulevasta talouskehityksestä ja avusti sopivan talouspolitiikan määrittämisessä alueilla, jotka vaihtelevat asumisesta koulutukseen.
Dynan toimi Tulodynamiikan Paneelitutkimuksen johtokunnan puheenjohtajana ja toimi Bureau of Economic Analysis Advisory Committeessa, U. S. Financial Diaries Advisory Boardissa ja American Economic Association Committee on Economic Statistics-komiteassa.