Kinome

tämä artikkeli käsittelee termiä molekyylibiologiassa. Kasvi ja ravinto, katso Zanthoxylum piperitum.

molekyylibiologiassa, biokemiassa ja solujen signaloinnissa eliön kinomi on sen genomiin koodattu proteiinikinaasien kokonaisuus. Kinaasit ovat yleensä entsyymejä, jotka katalysoivat (aminohappojen) fosforylaatioreaktioita ja jakautuvat useisiin ryhmiin ja perheisiin, esim.ne, jotka fosforyloivat aminohapot seriini ja treoniini, ne, jotka fosforyloivat tyrosiini ja jotkut, jotka voivat fosforyloida molemmat, kuten MAP2K-ja GSK-perheet. Termiä käytettiin ensimmäisen kerran vuonna 2002 Gerard Manningin ja kollegoiden kaksospapereissa analysoimassa 518 ihmisen proteiinikinaasia, ja se viittaa sekä proteiinikinaaseihin että proteiini pseudokinaaseihin ja niiden proteiinikinaasien kehittymiseen kaikkialla eukaryooteissa. Muita kinomeja on määritetty riisille, useille sienille, sukkulamadoille ja hyönteisille, merisiileille, Dictyostelium diskoideumille ja Mycobacterium tuberculosis-bakteerin aiheuttamalle infektiolle. Vaikka proteiinikinaasien primaarisekvenssi osoittaa huomattavaa eroa toisiinsa liittymättömien eukaryoottien välillä ja aminohappojen erot katalyyttisissä motiiveissa ovat mahdollistaneet kinomien erottamisen kanonisiin ja pseudokinaasi-alatyyppeihin, eukaryoottisten kinaasien substraattien varsinaisen fosforylaatiokohdan viereisissä aminohappomotiiveissa havaittu vaihtelu on paljon pienempi.

koska kinaasit ovat tärkeä lääkekohde ja tärkeä kontrollipiste solujen käyttäytymisessä, kinomi on ollut myös suuren mittakaavan funktionaalisen genomiikan kohde RNAi-näytöillä ja huumeiden löytöponnistelujen kohteena, erityisesti syöpähoidoissa.

eläimillä kinomiin kuuluvat kinaasit, jotka fosforyloivat vain tyrosiinia (tyrosiinikinaasit), ne, jotka vaikuttavat seriiniin tai treoniiniin, sekä muutama luokka, kuten GSK3 ja MAP2K, jotka voivat vaikuttaa molempiin. Tutkimukset ovat osoittaneet, että on olemassa erikoistuneita proteiinidomeeneja, jotka sitoutuvat fosforyloituneisiin seriini-ja treoniinijäämiin, kuten BRCA-ja FHA-domeeneihin.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.