OMIM Entry – * 609132-LYSIINIDEMETYLAASI 1A; KDM1A

teksti

Histoni H3: n metylaatio (katso 602810) lys4 (h3k4) on tärkeä epigeneettinen muunnos, joka liittyy geenin aktivaatioon. H3k4 – di-ja trimetylaatiojäämät (h3k4me2 ja h3k4me3) merkitsevät aktiivisesti litteroitujen geenien transkription aloituspaikkoja, kun taas h3k4-monometylaation (h3k4me1) korkea taso liittyy tehostajasekvensseihin. KDM1A ja KDM1B (613081) ovat h3k4me1: n ja H3K4me2: n demetylaaseja ja aiheuttavat geenien sortoa (Yhteenveto Shao et al., 2014).

sekvensoimalla klooneja, jotka on saatu kokofraktioidusta aivojen cDNA-kirjastosta, Nagase et al. (1998) kloonasi KDM1A: n, jota he kutsuivat nimellä KIAA0601. Päätelty proteiini sisältää 886 aminohappoa. RT-PCR havaitsi kdm1a: n ilmentymistä lähes kaikissa testatuissa kudoksissa, ja suurimmat pitoisuudet olivat munuaisissa ja kiveksissä. Haimassa ja pernassa havaittiin vain vähän tai ei lainkaan ilmettä.

Shi ym. (2004) raportoi, että kdm1a-proteiinilla, jota he kutsuivat LSD1: ksi, on N-terminaalinen pyörre-domeeni, joka löytyy kromatiinin säätelyyn osallistuvista proteiineista, joita seuraa FAD-sitova motiivi ja amiinioksidaasi-domeeni. Etsimällä proteiineja, joissa oli sekä amiinioksidaasi-että SWIRM-domeeneja, he tunnistivat aof1: n (KDM1B) ihmisen LSD1: n kaltaiseksi proteiiniksi sekä useita LSD1: n kaltaisia proteiineja C. elegansista, Drosophilasta, Arabidopsiksesta ja S. pombesta.

Hakimi ym. (2003) identified a family of multiprotein corepressor complexes that function through modifying kromatin structure to keep genes silent. Näiden kompleksien polypeptidikoostumukseen kuuluu yhteinen 2 alayksikön ydin, HDAC1 (601241)/HDAC2 (605164) ja FAD: tä sitova proteiini AOF2, jota kirjoittajat kutsuivat BHC110: ksi. Muita näiden kompleksien alayksiköitä ovat znf261 (300061), GTF2I (601679) ja syöpää aiheuttaviin kromosomitranslokaatioihin liittyvät polypeptidit.

Histoni-N-terminaalisen häntärakenteen translaation jälkeiset muutokset ja geenin transkriptio. Shi ym. (2004) totesi, että vaikka sekä asetyylitransferaasit että deasetylaasit määräävät histonin asetylaation laajuuden, on ollut epäselvää, säätelevätkö histonin metylaatiota myös entsyymit, joilla on vastakkaisia toimintoja. He esittivät todisteita siitä, että lsd1, amiinioksidaasien ydinhomologia, toimii histonidemetylaasina ja transkriptiokorepressorina. LSD1 erityisesti demetyloitu H3K4, joka liittyy aktiiviseen transkriptioon. Lysiinin demetylaatio tapahtui hapetusreaktiolla, jossa syntyi formaldehydiä. RNA-interferenssin aiheuttama lsd1: n inhibitio aiheutti h3k4-metylaation lisääntymistä ja kohdegeenien samanaikaista derepressiota, mikä viittaa siihen, että LSD1 tukahduttaa transkription histonidemetylaatiolla. Tulokset tunnistivat siten histonidemetylaasin, joka säilyi S. pombesta ihmiseen, ja osoittivat histonimetylaation dynaamista säätelyä sekä histonimetylaasien että demetylaasien toimesta.

Forneris ym. (2005) todettiin, että rekombinantti ihmisen lsd1 käyttäytyi oksidoreduktaasi/oksidaasi-luokan tyypillisen flavoentsyymin tavoin in vitro. LSD1 katalysoi substraattinsa 2-elektronin hapettumista ja muutti hapen vetyperoksidiksi. LSD1: n c-terminaalinen 702-aminohappo sisälsi funktionaalisen histonin demetylaatiokohdan ja tiiviisti sitoutuneen FAD: n, mikä osoittaa, että n-terminaaliset aminohapot eivät ole ratkaisevia aktiivisuuden tai kofaktorin sitoutumisen kannalta. Forneris ym. (2005) totesi, että vetyperoksidin tuottaminen kromatiiniympäristössä saattaa suosia DNA: n oksidatiivisia vaurioita ja saattaa olla haitallista. He ehdottivat, että LSD1 ei välttämättä toimi oksidaasina in vivo ja että muut molekyylit kuin happi voivat toimia elektronien vastaanottajina demetylaatioreaktioissa.

Shi ym. (2005) todettiin, että rekombinantti ihmisen lsd1 ei pystynyt demetyloimaan nukleosomaalisia substraatteja, mutta HeLa-soluista puhdistettu Lsd1 demetyloi histoneja riippumatta siitä, olivatko substraatit bulkkihistoneja vai nukleosomeiksi koottuja histoneja. Massaspektrometrialla ja Western blot-analyysillä he havaitsivat, että lsd1 liittyy kompleksiin, joka sisältää muun muassa HDAC1: n, HDAC2: n, CTBP1: n (602618), RCOR: n (607675), BHC80: n (608325) ja BRAF35: n (HMG20B; 605535). Tässä ryhmässä rcor sääteli positiivisesti LSD1: n toimintaa in vitro ja BHC80 inhiboi RCOR/LSD1-välitteistä demetylaatiota. Hyperasetyloidut nukleosomit olivat vähemmän herkkiä RCOR / LSD1-välitteiselle demetylaatiolle, mikä viittaa siihen, että hypoasetyloidut nukleosomit saattavat olla suositeltavia fysiologisia substraatteja. Shi ym. (2005) ehdotti, että histonideasetylaasit ja LSD1 voivat tehdä yhteistyötä repressiivisen kromatiiniympäristön luomiseksi.

Lee ym. (2005) osoitti, että BHC110: tä sisältävät kompleksit osoittivat Histoni H3K4: n demetylaation lähes 5-kertaistuvan verrattuna rekombinantti BHC110: een. Lisäksi rekombinantti BHC110 ei pystynyt demetyloimaan h3k4: ää nukleosomeilla, mutta BHC110: tä sisältävät kompleksit demetyloivat nukleosomeja helposti. BHC-kompleksin in vitro uudelleenvalmistaminen rekombinanttialayksiköitä käyttäen paljasti, että sillä on keskeinen rooli RESOREPRESSORISESSA Corestissa (607675), ei ainoastaan ydinhistorioiden demetylaation stimuloinnissa, vaan myös nukleosomaalisten substraattien demetylaation edistämisessä. Lee ym. (2005) totesi, että nukleosomaalinen demetylaatio oli seurausta siitä, että CoREST paransi BHC110: n ja nukleosomien välistä yhteyttä. Corestin loppuminen in vivo-soluviljelmässä johti LEPOVASTEISEN geeniekspression poistumiseen ja h3k4: n metylaation lisääntymiseen. Yhdessä, Lee et al. (2005) totesi, että niiden tulokset korostavat Corestin keskeistä roolia H3K4: n demetylaatiossa sekä in vitro että In vivo.

Metzger ym. (2005) osoitti, että lsd1 kolokalisoituu androgeenireseptorin (AR; 313700) kanssa normaalissa ihmisen eturauhasen ja eturauhasen kasvaimessa. LSD1 oli vuorovaikutuksessa AR: n kanssa in vitro ja In vivo ja stimuloi AR: sta riippuvaista transkriptiota. Vastaavasti lsd1-proteiinitasojen knockdown kumosi androgeenin indusoiman transkriptioaktivaation ja solujen proliferaation. Kromatiinin immunopresipitaatioanalyysit osoittivat, että AR ja LSD1 muodostavat kromatiiniin liittyviä komplekseja ligandiriippuvaisesti. LSD1 lievittää repressiivisiä histonijälkiä demetyloimalla Histoni H3: A lysiini-9: ssä (H3K9), mikä johtaa AR: n kohdegeenien derepressioon. Lisäksi Metzger ym. (2005) tunnisti pargylinen lsd1: n estäjäksi. Pargyline estää H3K9: n demetylaation lsd1: llä ja siten AR-riippuvaisen transkription. Näin ollen lsd1: n toiminnan Mukauttaminen tarjoaa strategian AR-funktioiden säätelyyn. Metzger ym. (2005) linkitti repressiivisen histonimerkin demetylaation AR-riippuvaiseen geeniaktivaatioon, mikä tarjoaa mekanismin, jolla demetylaasit kontrolloivat spesifistä geeniekspressiota.

Wang et al. (2007) ilmoitti, että histonilysiinidemetylaasi LSD1, joka on osa CoREST-CtBP: tä (602618), tarvitaan myöhäisen solulinjan määrittämiseen ja erilaistumiseen aivolisäkkeen organogeneesin aikana. LSD1 näyttää toimivan ensisijaisesti kohdegeenin aktivointiohjelmissa, kuten myös geenien torjuntaohjelmissa, perustuen erillisten LSD1: tä sisältävien koaktivaattori-tai korepressorikompleksien rekrytointiin. LSD1-riippuvaisten geenien torjuntaohjelmia voidaan laajentaa myöhäisessä kehityksessä zeb1: n (189909) indusoidulla ilmentymisellä, joka on Kruppelin kaltainen repressori, joka voi toimia molekyylimajakkana LSD1: tä sisältävän CoREST-CtBP: n corepressorikompleksin rekrytoinnissa, aiheuttaen sortoa ylimääräiselle geenikohortille, kuten Gh: lle (139250), joka aiemmin vaati lsd1: tä aktivointiin. Wang ym. (2007) totesi, että lsd1-kompleksien tiettyjen komponenttien ilmentymisen ajalliset mallit moduloivat geenien säätelyohjelmia monissa nisäkkäiden elimissä.

koimmunoprecipitation assays with mouse and human cells, Saleque et al. (2007) osoitti, että lsd1, COREST, HDAC1, ja HDAC2 vuorovaikutuksessa sekä gfi1 (600871) ja GFI1B (604383) endogeenisissä komplekseja. GFI1: n ja GFI1B: N N-terminaalista SNAG-sortoaluetta vaadittiin, koska ne olivat yhteydessä CORESTIIN ja LSD1: een. Hiiren gfi1b rekrytoi nämä kofaktorit valtaosaan kohdegeenin promoottoreista in vivo. Hiiren punasolujen, megakaryosyyttisten ja granulosyyttisten solujen sekä primaaristen punasolujen kantasolujen Corest-ja Lsd1-häiriintyneen erilaistumisen estäminen. Lsd1: n poistuminen poisti GFI: n tavoitteet lineaarisesti määritellyissä kaavoissa, ja siihen liittyi tehostunut H3-lys4-metylaatio kyseisissä promoottoreissa. Saleque ym. (2007) päätteli, että GFI-kompleksit katalysoivat kohteidensa sarjahistonimuuntelua, mikä johtaa niiden asteittaiseen hiljentymiseen.

Huang ym. (2007) osoitti, että ihmisen soluissa Histoni-lysiinispesifinen demetylaasi LSD1 vuorovaikuttaa p53: n (191170) kanssa tukahduttaakseen p53-välitteisen transkriptioaktivaation ja estääkseen p53: n roolin apoptoosin edistämisessä. He havaitsivat, että in vitro LSD1 poistaa sekä monometylaation (K370me1) että dimetylaation (k370me2) k370: ssä, joka on Smyd2: sta (610663) riippuvainen monometylointipaikka. In vivo LSD1 osoitti kuitenkin suosivansa voimakkaasti käänteistä K370me2: ta, jonka suorittaa erillinen, mutta tuntematon metyylitransferaasi. Huang ym. (2007) totesi, että K370me2: lla on erilainen rooli p53: n säätelyssä kuin k370me1: llä: K370me1 tukahduttaa p53: n funktion, kun taas K370me2 edistää yhteistyötä coactivator 53BP1: n (605230) kanssa. Huang et al. (2007) osoitti, että p53: a säännellään dynaamisesti lysiinimetylaatiolla ja demetylaatiolla ja että metylaatiotila yhdellä lysiinijäämällä antaa erillisen sääntelytehon.

Perillo ym. (2008) analysoi, miten H3-histonin metylaatio ja demetylaatio säätelevät estrogeenireseptorien ilmentymistä ja osoitti, että DNA: han sitoutunut estrogeenireseptori (KS.ESRA; 133430) ohjaa transkriptiota osallistumalla kromatiinin taivuttamiseen kontaktiin promoottoriin rekrytoituun RNA-polymeraasi II: een (KS. 180660). Tätä prosessia ohjaa reseptoreihin kohdistuva h3k9: n demetylaatio (KS.601128) sekä tehostaja-että promoottorialueilla, ja se saadaan aikaan paikallisen lsd1-demetylaasin aktivaatiolla. Paikallinen demetylaatio tuottaa vetyperoksidia, joka muuttaa ympäröivää DNA: ta ja värittää 8-oksoguaniini-DNA-glykosylaasia 1 (601982) ja topoisomeraasi II-beetaa (126431), mikä käynnistää kromatiinin ja DNA: n konformaatiomuutokset, jotka ovat välttämättömiä estrogeenin indusoimalle transkriptiolle. Perillo ym. (2008) totesi, että heidän tietonsa osoittivat strategian, joka käyttää kontrolloitua DNA-vaurioita ja korjausta ohjaamaan tuottavaa transkriptiota.

transkriptiokorepressorikompleksi, joka sisältää LSD1: n, CORESTIN ja HDAC1: n, estää transkription poistamalla transkriptioaktivaatioon liittyvät histonimuutokset. Gocke ja Yu (2008) havaitsivat, että ZNF198 (ZMYM2; 602221) ja REST (600571) olivat vuorovaikutuksessa lsd1/COREST/HDAC1: n kanssa toisensa poissulkevalla tavalla ihmisen solulinjoissa. ZNF198: AA tarvittiin E-cadherinin (CDH1; 192090) torjuntaan, mutta ei lepoon reagoivia geenejä. ZNF198 reagoi kromatiinin kanssa ja stabiloi kromatiinin lsd1/COREST/HDAC1-kompleksin. ZNF198: n MYM-alue välitti znf198: n vuorovaikutusta LSD1/COREST/HDAC1: n kanssa. SUMO2: n (603042) aiheuttama HDAC1: n sumoylaatio paransi sen sitoutumista ZNF198: aan epäkovalenttisen mekanismin kautta, mutta se heikensi myös HDAC1: n ja CORESTIN vuorovaikutusta.

käyttäen kromatiini-immunoprecipitaatiota, PCR: ää, koimmunoprecipitaatiota ja reporter analyses, Liang et al. (2009) todettiin, että alfaherpesvirusten, herpes simplex-viruksen (HSV; KS.610551) ja varicella zoster-viruksen (VZV), aiheuttama infektio johti kromatiinin nopeaan kertymiseen repressiivisellä Histoni H3 lys9 (H3K9) metylaatiolla. Viruksen välittömien varhaisten (IE) geenien ilmentyminen edellytti isäntäsolutekijä 1: tä (HCF1 tai HCFC1; 300019) lsd1: n värväämiseksi viruksen välittömiin varhaisiin promoottoreihin. Lsd1: n loppuminen tai annosriippuvainen lsd1: n estyminen monoamiinioksidaasin estäjillä (MAO-estäjillä) johti repressiivisen kromatiinin kertymiseen ja estoon viruksen geeniekspressiolle. HCF1, yhdessä SET1: n (SETD1A; 611052) ja MLL1: n (159555) kanssa, repressiivisten H3K9-metylaatiotasojen koordinoitu Mukauttaminen lisäämällä aktivoivia H3K4-trimetylaatiomerkkejä. Liang ym. (2009) totesi, että LSD1 estää h3k9-metylaation kertymistä ja mahdollistaa molempien alfaherpesvirusten tuottavan infektion. He ehdottivat, että viruspatogeenien riippuvuus isäntäsolukoneistosta korostaa mahdollista terapeuttista interventiota ja että lsd1: n kohdistaminen laajalti käytettyihin Mao-estäjiin voi estää virusten latenssin ja uudelleenaktivoitumisen.

Wang et al. (2009) osoitti, että lsd1: tä tarvitaan gastrulaatioon hiiren alkiogeneesin aikana. Erityisesti lsd1: tä koodaavan geenin kohdennettu poistaminen alkion kantasoluista aiheuttaa asteittain vähenevän DNA: n metylaation häviämisen. Tämä häviö korreloi DNA-metyylitransferaasi-1: n (DNMT1; 126375) proteiinin vähenemisen kanssa dnmt1: n heikentyneen stabiilisuuden seurauksena. Dnmt1-proteiini metyloidaan in vivo, ja sen metylaatio tehostuu lsd1: n puuttuessa. Lisäksi Dnmt1 voidaan metyloida set7/9: llä (tunnetaan myös nimellä KMT7, 606594) ja demetyloida lsd1: llä in vitro. Wang ym. (2009) totesi, että LSD1 demetyloi ja stabiloi Dnmt1: tä, mikä tarjoaa aiemmin tuntemattoman mekanistisen yhteyden Histoni-ja DNA-metylaatiojärjestelmien välille.

käyttäen ihmisen K562 ja hiiren MEL erytroleukemiasoluja ja ihmisen Jurkat T-solujen leukemiasoluja, Hu et al. (2009) osoitti, että transkriptiotekijä TAL1 (187040) oli suoraan vuorovaikutuksessa lsd1: n kanssa 2 erillisenä HDAC1-proteiinikompleksina. LSD1 esti tal1-välitteisen reportterin toimintaa annosriippuvaisesti, ja tämä inhibitio vaati lsd1: n histonidemetylaasidomeenin. Tal1 liittyi lsd1-ja demetylaasiaktiivisuuteen erilaistumattomissa MEL-soluissa, mutta ei aikana, jolloin MEL-solut sitoutuivat erilaistumaan. Tal1: n liittyminen Lsd1-kompleksiin havaittiin erilaistumisen loppuvaiheessa. Tal1 sitoi 2 e-box GATA-motiivia punasoluproteiinia P4.2 (EPB42; 177070) koodaavan geenin proksimaaliseen promoottoriin ja kohdisti lsd1: n P4.2-promoottoriin. Lsd1: n kohdistaminen P4.2-promoottoriin korreloi H3K4-metylaation kanssa P4.2-promoottorissa. Erilaistumisen jälkeen lsd1 irtautui promoottorista sallien Tal1-välitteisen P4.2-transkription. Lsd1: n tyrmääminen lyhyen hiusneula-RNA: n kautta MEL-soluissa lisäsi P4: n ilmentymistä.2 ja Gata2 (137295) ja dimetyloidun H3K4: n lisäys P4.2-promoottorissa. Hu ym. (2009) totesi, että LSD1: n h3k4-histonidemetylaasiaktiivisuus on osittain vastuussa tal1: n tukahduttavasta aktiivisuudesta ja rajoittaa TAL1: n toimintaa hematopoieesissa.

Metzger ym. (2010) osoitti, että histonin H3 (601128) fosforylaatio treoniini-6: ssa (H3T6) proteiinikinaasi C (PKC)-beeta-1 (176970) on avaintapahtuma, joka estää LSD1: tä demetyloimasta H3K4: ää androgeenireseptorista (AR; 313700) riippuvaisen geenin aktivaation aikana. In vitro lysiini-4: ssä metyloidut Histoni-H3-peptidit ja treoniini-6: ssa fosforyloidut Histoni-H3-peptidit eivät enää olleet lsd1-substraatteja. In vivo, PKC-beeta-1 kolokalisoidaan AR: lla ja LSD1: llä kohdegeenin promoottoreihin ja fosforyloidaan h3t6 androgeenin indusoiman geenin ilmentymisen jälkeen. PKC-beeta-1: n RNAi-välitteinen knockdown kumosi h3t6-fosforylaation, paransi demetylaatiota h3k4: ssä ja esti AR-riippuvaista transkriptiota. PKCB1: n aktivoituminen edellyttää androgeeniriippuvaista gatekeeper-kinaasiproteiinikinaasi C: hen liittyvän kinaasin 1 (PRK1; 601032) rekrytointia. Pkcb1: n ja fosforyloidun H3T6: n (H3T6ph) lisääntynyt pitoisuus korreloi positiivisesti eturauhassyöpäkasvainten korkeisiin Gleason-pistemääriin ja PKC-beeta-1: n esto esti AR: n aiheuttaman kasvainsolujen proliferaation in vitro ja syövän eteneminen kasvainsiirteissä in vivo. Yhdessä, Metzger ym. (2010) totesi, että androgeeniriippuvainen kinaasisignalointi johtaa uuden kromatiinimerkin H3T6ph kirjoittamiseen, mikä näin ollen estää aktiivisten metyylimerkkien poistamisen H3K4: stä AR-stimuloidun geenin ilmentymisen aikana.

Whyte ym. (2012) osoitti, että histonin demetylaasi LSD1, joka demetyloi histonin H3 lys4: ään tai lys9: ään (H3K4/K9), on välttämätön käytöstäpoistoa edistävissä valmisteissa hiiren alkion kantasolujen (ESC) erilaistumisen aikana. LSD1: ssä on aktiivisten geenien tehostajia, jotka ovat kriittisiä ESCs: n tilan säätelyn kannalta. LSD1 ei kuitenkaan ole välttämätön ESC-identiteetin säilymisen kannalta. Sen sijaan ESC: t, joilla ei ole lsd1-aktiivisuutta, eivät pysty täysin erilaistumaan, eivätkä ESC-spesifiset tehostajat läpäise erilaistumiseen liittyviä histonin demetylaatiotapahtumia. Aktiivisissa tehostimissa LSD1 on osa NuRD-kompleksia (nukleosomin remodelointi ja histonideasetylaasi), joka sisältää ESC-erilaistumiseen tarvittavia alayksiköitä. Whyte ym. (2012) ehdotti, että lsd1-NuRD complex käytöstäpoistoa tehostavat pluripotency-ohjelman erilaistumisen aikana, mikä on välttämätöntä ESC-geeniekspressio-ohjelman täydelliselle sammumiselle ja siirtymiselle uusiin solutiloihin.

Shao et al. (2014) tutki h3k4me: n ja sen keskeisten säätelijöiden muutoksia hiiren varhaismunasoluissa ja preimplantaatioalkioissa. He havaitsivat kohonneita h3k4me2 – ja h3k4me3-pitoisuuksia 1-2-soluvaiheissa, mikä vastaa alkion genomin aktivaatiovaihetta. H3K4me2-taso laski dramaattisesti 4-soluvaiheessa ja pysyi matalana blastokystivaiheeseen asti. Sen sijaan h3k4me3-taso laski hetkellisesti 4-soluisissa alkioissa, mutta nousi tasaisesti huippuunsa blastokysteissä. Kvantitatiiviset reaaliaikaiset PCR-ja immunofluoresenssianalyysit osoittivat, että h3k4me2: n korkea pitoisuus alkion genomiaktivaation aikana tapahtui samaan aikaan sen Metyylitransferaasin Ash2l (604782) huippuekspression kanssa ja samanaikaisesti sen demetylaasien kdm5b (605393) ja Kdm1a väheneminen. H3K4me3 korreloi sen metyylitransferaasin kmt2b (606834) ja demetylaasin kdm5a ilmentymisen kanssa (180202) kanssa. Shao ym. (2014) ehdotti, että nämä entsyymit toimivat alkion genomin aktivoinnissa ja ensimmäisen linjan erottelussa esiimplantaatiohiiren alkioissa.

käyttäen kromatiini-immunoprecipitaatio-sekvensointimääritystä, Gao et al. (2020) osoitti, että LSD1 interacted with FOXA1 (602294) and active enhancer markers in human prostate cancer cells and that LSD1 inhibition disturbed global FOXA1 kromatin binding. LSD1 säätelee positiivisesti FOXA1-kromatiinin sitoutumista demetyloimalla Foxa1: n K270. Tämän mekanismin kautta LSD1 ylläpiti tehostimen saavutettavuutta AR: lle ja säänneltyä AR-kromatiinin Sidonta-ja transkriptiolähtöä. Lsd1-estäjät tukahduttivat ksenograftin kasvaimen kasvun kuohituilla hiirillä estämällä Foxa1 K270-demetylaation. Lisäanalyysi osoitti, että lsd1: n estäjien teho tuumorinsuppressioon korreloi foxa1: n ekspressiotasojen kanssa ja että Lsd1: n estäjät toimivat synergiassa Ar-antagonistihoidon kanssa.

By radiation hybrid analysis, Nagase et al. (1998) kartoitti aof2-geenin kromosomiin 1.

Gross (2014) kartoitti kdm1a-geenin kromosomiin 1p36.12 perustuen kdm1a-sekvenssin (GenBank BC048134) sovittamiseen genomisarjan (GRCh37) kanssa.

a report by Nunez et al. (2008) osoitti, että 3-ulotteinen Moottori-riippuvainen interchromosomal interactions mukana LSD1 tarvitaan saavuttaa parannettu transkriptio tiettyjen estrogeeni-reseptorin kohde-geenit vedettiin takaisin.

Tunovic ym. (2014) ilmoitti potilaan, jolla oli kehitysviive ja erottuvat kasvonpiirteet (CPRF; 616728), joka kantoi heterotsygoottista missense-mutaatiota kdm1a-geenissä (Y785H; 609132.0001). Tällä potilaalla oli myös ankrd11-geenissä in-frame 3-nukleotidipoisto, mutaatiot, jotka aiheuttavat KBG-oireyhtymän (148050), sekä pieni päällekkäisyys, jonka merkitystä ei tiedetä. Chong ym. (2016) raportoi 2 muuta potilasta, joilla on heterotsygoottisia missense-mutaatioita KDM1A-geenissä (E403K, 609132.0002; D508G, 609132.0003). Kaikilla kolmella potilaalla oli piirteitä, jotka olivat päällekkäisiä Kabukin syndrooman (147920) kanssa. Mitään variantteja ei löytynyt yli 71,000-kontrollipeksomeista julkisista ja sisäisistä tietokannoista. Vaikka Tunovic et al. (2014) katsoi, että sekä ANKRD11: n että kdm1a: n mutaatiot, jotka havaittiin heidän potilaallaan, ovat vaikuttaneet fenotyyppiin, Chong et al. (2016) ei pitänyt ANKRD11-mutaatiota patogeenisenä, koska useimmat KBG-oireyhtymään johtavat ankrd11-mutaatiot ovat frameshift-tai nonsense-mutaatioita, eikä ANKRD11 ole kovin säilyvä ja on erittäin polymorfinen yleisväestössä. Tunovic ym. (2014) totesi, että KDM1A geeni on top 2% evolutionary rajoittunut geenit (eli, geenit, jotka eivät siedä toiminnallista vaihtelua) (Samocha et al., 2014).