perinteinen luokittelu määräsi yksisoluisille eukaryooteille eli protisteille jaon kasvien ja eläinten kaltaisiin muotoihin; nykyisen näkemyksen mukaan protistit ovat monimuotoinen kasvi-, eläin – ja sienimäisten ryhmien kokonaisuus. Niiden luokittelu fylaan on vaikeaa niiden suhteellisen yksinkertaisen rakenteen ja rajallisen geologisen kirjauksen vuoksi, mutta ultrarakenteiden ja muiden ominaisuuksien tutkiminen tarjoaa uutta tietoa protistiseen luokitteluun. Mahdollisista luokitteluista keskustellaan, ja esitetään elollisen maailman tiivistettyä luokittelua kuningaskuntiin (Monera, Protista, Fungia, Animalia, Plantae) ja fylaan. Tämä luokittelu viittaa myös fylan ryhmittelyihin superfylaan ja muotoon-superfylaan sekä laajenevaan kuningaskilpeen (mukaan lukien viherlevät, oomycotes ja limalevät, mutta ei punaisia ja ruskeita leviä). Luokittelu pyrkii siten tarjoamaan kompromissin Whittakerin ja Margulisin protististen ja protokististen kuningaskuntien välillä ja yhdistämään täydellisen luettelon fyloista ja näiden ryhmittelyn synoptista hoitoa varten.
