Macklis a reçu un double baccalauréat en génie bioélectrique et littérature du Massachusetts Institute of Technology. Il a obtenu son doctorat et son doctorat en 1984 du Harvard–MIT Program of Health Sciences and Technology (HST), où il a été conseillé par Richard L. Sidman. Il a complété une bourse postdoctorale en neurosciences du développement avec Sidman. Macklis a suivi une formation clinique en médecine interne à l’Hôpital Brigham and Women’s Hospital (BWH) et en neurologie pour adultes dans le cadre du programme de formation neurologique Harvard-Longwood.
Macklis a d’abord établi son laboratoire dans la Division des sciences fondamentales des Neurosciences de l’Hôpital pour enfants de Boston (BCH). En 2002, il a déménagé au Massachusetts General Hospital (MGH), où il a été le directeur fondateur du Centre MGH-HMS pour la réparation du Système nerveux (2002-2011). Il a également codirigé le Programme de la Maladie de Parkinson et des troubles connexes au BWH.
En 2004, Macklis a fondé le Programme Neuroscience/Maladies du Système Nerveux au Harvard Stem Cell Institute de l’Université Harvard, qu’il a dirigé jusqu’en 2013. En 2007, Macklis a été nommé Professeur Max et Anne Wien de Sciences de la vie. Son laboratoire a déménagé physiquement à Cambridge, MA en 2011. Il est membre du corps professoral des programmes d’études supérieures de Harvard en Neurosciences; Sciences Biologiques et Biomédicales; Biologie du Développement et de la Régénération; et Molécules, Cellules et Organismes; ainsi que du programme Harvard-MIT HST.
Macklis est devenu un chercheur distingué du Groupe Frontiers de Paul G. Allen en 2015. Il est devenu chercheur de l’Initiative de recherche sur l’autisme de la Fondation Simons (SFARI) en 2017.
