Khama est probablement le mieux connu pour avoir pris trois décisions cruciales au cours de son mandat en tant que chef. Premièrement, bien qu’il ait aboli la cérémonie de bogwera elle-même, Khama a conservé les régiments de mephato comme source de travail gratuit à diverses fins économiques et religieuses. La portée des responsabilités de travail d’un mephato s’étendra plus tard considérablement sous le règne du fils de Khama, Tshekedi, dans la construction d’écoles primaires, de silos à céréales, de systèmes de réticulation de l’eau et même d’un collège nommé Moeng situé à la périphérie de Serowe, qui sous le règne de Khama était devenue la capitale Bamangwato. De concert avec le mephato, Khama a introduit une foule d’améliorations technologiques européennes sur le territoire de Bamangwato, y compris le mogoma, ou charrue à bois tirée par des bœufs (à la place de la houe à main) et des wagons pour le transport (à la place des traîneaux).
Dans le monde d’aujourd’hui, le mephato pourrait être considéré comme une forme d’exploitation de l’entraide communautaire. Les hommes et les femmes de Bangwato devaient participer à des projets de travail assignés lorsque leurs régiments étaient appelés au service. Et ils étaient appelés, au sens littéral du terme. Une personne désignée du village montait au sommet de la colline de Serowe et criait littéralement le nom du mephato qui devait commencer les travaux. Tous les membres du mephato abandonnaient tout ce qu’ils faisaient et commençaient leur tournée de service de six mois, sans aucun soutien matériel du village (en particulier sans contribution organisée de nourriture). On s’attendait généralement à ce que le mephato se débrouille tout seul pendant sa mission de travail.
Après que Khama est devenu roi en 1875, après avoir renversé son père Sekgoma et donné un coup de coude à son frère Kgamane, son ascension a eu lieu à un moment de grands dangers et opportunités. Des incursions ndébélé du nord (de l’actuel Zimbabwe), des randonneurs boers et « mixtes » du sud, et des forces allemandes de l’Ouest, tous espérant s’emparer de son territoire et de son arrière-pays. Il a répondu à ces défis en alignant son État sur les objectifs administratifs des Britanniques, qui lui fournissaient couverture et soutien, et, parallèlement, en étendant énergiquement son propre contrôle sur une zone beaucoup plus large que n’importe quel « kgosi » avant lui. Khama s’est converti au christianisme, ce qui l’a poussé à criminaliser le sectarisme et à déprécier les institutions favorisées par les traditionalistes. À la demande de Khama, des lois strictes ont été adoptées contre l’importation d’alcool. Pour faire respecter l’interdiction de l’alcool, les blancs ont été bannis de son royaume.
Le gouvernement britannique lui-même avait deux idées quant à ce qu’il fallait faire du territoire. Une faction, soutenue par un missionnaire local du nom de John Mackenzie, préconisait l’établissement d’un protectorat, tandis qu’une autre faction, dirigée par Cecil Rhodes, adoptait une position plus affirmée et exigeait que le pays soit ouvert à la colonisation européenne et à l’exploitation économique. La résolution est intervenue en 1885, lorsque le territoire au sud de la rivière Molopo est devenu la colonie du Bechuanaland britannique, tandis que le territoire au nord de la rivière est devenu le protectorat du Bechuanaland. La colonie a finalement été incorporée à la Colonie britannique du Cap et fait maintenant partie de l’Afrique du Sud.
Rhodes poursuit sa campagne pour faire pression sur son gouvernement pour qu’il annexe ce qui reste du territoire de Khama. En 1895, avec deux autres chefs de tribus voisines, Bathoen I et Sebele I, Khama se rendit en Grande–Bretagne pour faire pression sur la Reine pour qu’elle soit protégée des doubles pressions de la British South Africa Company de Cecil Rhodes – située dans ce qui allait devenir plus tard la Rhodésie au nord – et des colons afrikaners venant du Sud. Parce que le voyage était organisé par des missionnaires, le christianisme de Khama a été la pièce maîtresse de la campagne. Les chefs ont beaucoup voyagé à travers la Grande-Bretagne, s’adressant à un large public évangélique. Non seulement la biographie de Khama a-t-elle été écrite à cette époque, mais il a reçu de nombreuses autres publications qui ont cimenté sa légende en tant que chrétien africain. Le voyage en Grande-Bretagne des trois rois Tswanas s’est finalement avéré un succès après le raid malheureux de Jameson en 1896, lorsque la réputation de Rhodes a été ruinée. Si Khama et ses compatriotes avaient été incapables de convaincre les autorités britanniques de la nécessité de protéger les Bamangwato avant le fiasco du raid Jameson, il est très probable qu’une grande partie de ce qui est aujourd’hui le Botswana aurait été absorbée par la Rhodésie et l’Afrique du Sud.
Khama III était inébranlable en imposant sa volonté christianisée à la tribu. Il a promu les écoles et a privilégié l’embauche de chrétiens instruits. Il interdit l’alcool sur les terres tribales (avec un succès variable), impose des moratoires sur la vente de bétail en dehors du territoire Bamangwato et des terres tribales en tant que concessions aux intérêts miniers et bovins étrangers, et abolit la polygamie. L’abolition de la polygamie était peut-être son geste le plus controversé. Certains soutiennent qu’à mesure que le christianisme se répandait plus tard parmi les autres tribus du protectorat et que la polygamie était universellement abolie, la « colle » sociétale qui maintenait les familles ensemble (étendue comme par la polygamie) s’est tarie.
