Un costume d’arbre de Noël gonflable porté à l’hôpital le décembre. 25 pourrait être en partie responsable de la propagation rapide du virus ce jour-là, car son ventilateur a peut-être fait circuler des particules de COVID dans l’air.
« C’était certainement une épidémie inhabituelle avec beaucoup de maladies, et elle semblait se propager assez rapidement », a déclaré Cody. « Nous essayons de comprendre si les caractéristiques de cette épidémie sont dues à cette variante: Cette variante du virus se comporte-t-elle différemment ou est-elle liée à d’autres facteurs présents à l’hôpital? C’est donc la question du jour. Nous avons en fait une équipe avec des collègues du département de la Santé publique de Californie et des Centers for Disease Control qui nous aident à essayer de comprendre cela. »
Le comté de Santa Clara a séquencé un grand nombre de spécimens positifs collectés sur des sites de tests communautaires et des épidémies dans le comté. « Dans le comté de Santa Clara, nous avons fait plus de recherches et, par conséquent, plus de découvertes », a expliqué Cody lors de la conférence de presse.
« Le fait que cette variante ait été identifiée dans plusieurs grandes épidémies dans notre comté est un drapeau rouge et doit faire l’objet d’une enquête plus approfondie », a déclaré Cody dans un communiqué. « Ce virus continue de muter et de s’adapter, et nous ne pouvons pas baisser la garde. Cette nouvelle souligne la nécessité pour chacun de suivre toutes les mesures de prévention et de se faire vacciner dès qu’on lui propose le vaccin. »
Cette variante identified identifiée pour la première fois l’année dernière dans d’autres pays et États, y compris la Californie is est différente de la variante B.1.1.7 détectée pour la première fois au Royaume-Uni. Comme le nombre de spécimens testés pour surveiller les souches variantes a augmenté dans les laboratoires californiens, y compris UCSF, la variante 452R a été identifiée plus fréquemment depuis novembre, ont déclaré des responsables du département de la Santé publique de Californie, du comté de Santa Clara et de l’Université de Californie à San Francisco.
Au cours d’un mois, la variante est passée de 3.8 pour cent des cas en Californie à 25,2 pour cent, a expliqué le Dr Charles Chiu, virologue de l’UCSF et professeur de médecine de laboratoire, lors de la conférence de presse. Chiu a séquencé des cas de plusieurs comtés de l’État au cours des derniers mois dans le cadre de l’initiative de séquençage du génome entier SARS-CoV-2 de l’État connue sous le nom de COVIDNet.
« Nous séquençons des échantillons de San Francisco », a déclaré Chiu lors de la conférence de presse. « J’ai discuté avec le département de la Santé publique de San Francisco pour faire peut-être une surveillance plus systématique, mais nous avons principalement séquencé des génomes de patients hospitalisés et ambulatoires dans les hôpitaux et cliniques UCSF, et à peu près les proportions sont les mêmes. En novembre, nous voyions moins de 5% des cas à San Francisco, mais maintenant, nous voyons environ un quart des infections, il y a deux semaines, semblent être cette variante. »
En dehors de la région de la Baie, la variante L452R a été détectée dans les comtés de Humboldt, Lake, Los Angeles, Mono, Orange, Riverside, San Bernardino, San Diego et San Luis Obispo. Étant donné que le séquençage génomique n’est pas effectué de manière égale dans tout l’État ou le pays, il est trop tôt pour savoir à quel point la variante 452 est répandue à l’échelle de l’État, au niveau national ou mondial, ont déclaré des responsables.
« Cette variante porte trois mutations, dont L452R, dans la protéine spike, que le virus utilise pour se fixer et pénétrer dans les cellules, et est la cible des deux vaccins actuellement disponibles aux États-Unis », a déclaré Chiu dans un communiqué. « Maintenant que nous savons que cette variante est en augmentation dans nos communautés locales, nous la priorisons pour l’étude. Les chercheurs de l’UCSF et d’ailleurs pourront maintenant effectuer les expériences de laboratoire critiques pour déterminer si ce virus est ou non plus infectieux ou affecte les performances du vaccin. »
Le CDPH s’est associé à des laboratoires de santé publique locaux, à des laboratoires de diagnostic, à Chan Zuckerberg Biohub, à Invitae Corporation, à UCSF et à l’Institut de recherche Scripps pour former COVIDNet, un réseau de laboratoires travaillant au séquençage du génome du SARS-CoV-2 dans l’État afin de comprendre la transmission et l’évolution du virus.
Chiu a déclaré que la variante du L452R n’était « pas une variante complètement nouvelle » et que le premier cas en Californie avait été décrit dans le comté d’Alameda en mai. « Le premier cas dans le monde était au Danemark en mars », a-t-il déclaré. « C’est donc une variante qui existe, mais elle a été très rare jusqu’en novembre. »
D’autres recherches doivent être effectuées concernant la transmissibilité de la variante, a déclaré Chiu.
« Nous ne savons pas encore si c’est plus contagieux », a-t-il déclaré. « Cependant, étant donné que maintenant c’est environ un quart des cas que nous voyons en Californie, peut-être encore plus à l’heure actuelle, il est préoccupant que cela puisse potentiellement être plus infectieux. »
Les premières données de laboratoire suggèrent que la localisation de cette mutation du variant sur la protéine spike critique du SARS-CoV-2 pourrait affecter la manière dont les anticorps neutralisants se lient au virus, ce qui pourrait avoir un impact sur l’efficacité des vaccins COVID-19, a déclaré Chiu. Des études similaires sont en cours sur les variantes du virus au Royaume-Uni, en Afrique du Sud et au Brésil.
« Il est important de comprendre que le virus peut se comporter d’une manière ou d’une autre en laboratoire et avoir certaines caractéristiques, mais il peut se comporter d’une manière très différente dans la vie réelle », a déclaré Cody. « J’imagine que c’est aussi quelque chose que nos collègues de la fabrication de vaccins examinent également en étudiant ces variantes. Je veux m’assurer que les plats à emporter ne sont pas que nous devions commencer à nous inquiéter à ce sujet. Je pense que le point à retenir est que c’est une variante qui devient de plus en plus répandue, et nous devons nous pencher et mieux comprendre à ce sujet. »
Cody a déclaré qu’il n’y avait encore aucune indication que cette variante entraîne des symptômes plus graves. « Nous n’avons aucun signal à ce stade que cette variation est associée à autre chose, telle qu’une gravité accrue de la maladie, bien que nous recherchions bien sûr des signaux pour voir si cela émergerait », a-t-elle déclaré.
En raison de l’augmentation continue des cas de COVID-19 et des hospitalisations, CDPH demande aux Californiens de continuer à prendre des mesures qui limiteront la transmission du virus et réduiront la pression sur nos systèmes de soins de santé. Cela inclut rester à la maison, sauf pour les activités essentielles, porter un masque en quittant la maison, limiter les interactions avec des personnes à l’extérieur de votre foyer immédiat, garder une distance physique d’au moins 6 pieds, se laver les mains pendant 20 secondes et recevoir le vaccin COVID-19 si vous êtes admissible et que le vaccin est disponible dans votre région.
« Il est courant d’identifier des variantes de virus comme le SARS-CoV-2, et nous travaillons avec nos partenaires fédéraux, locaux et universitaires pour mieux comprendre cette variante et son impact sur les Californiens », a déclaré le Dr. Erica Pan, épidémiologiste d’État pour le CDPH. « Il est trop tôt pour savoir si cette variante se propagera plus rapidement que d’autres, mais cela renforce certainement la nécessité pour tous les Californiens de porter des masques et de réduire le mélange avec des personnes en dehors de leurs foyers immédiats pour aider à ralentir la propagation du virus. Nous exhortons également toute personne exposée au virus à s’isoler des autres pour se protéger elle-même et protéger ses proches. »
