Discussion
Nommé d’après un microbiologiste slovaque, Miroslav Kocur, le genre Kocuria a été séparé du genre Micrococcus, dont les membres étaient connus au fil des ans sous le nom vernaculaire de « micrococci », qui chevauche le genre Arthrobacter. Lors d’une réévaluation de cet amas complexe d’Arthrobacter et de Micrococcus, un nouveau genre Kocuria a été proposé (1). Sur la base d’analyses phylogénétiques et chimiotaxonomiques, le genre Micrococcus a été divisé en genres Kocuria, Micrococcus, Kytococcus, Nesterenkonia et Dermacoccus. Un nouveau réarrangement les sépare en deux familles Micrococcaceae et Dermacoccaceae, toutes deux appartenant au sous-ordre des Micrococcineae. À ce jour, 19 espèces de Kocuria ont été décrites (1,2,14).
La péritonite causée par l’espèce Kocuria nécessite des tests de laboratoire pour le diagnostic, et l’isolement de l’organisme à partir d’échantillons d’effluents péritonéaux constitue le test de confirmation de la maladie. Cependant, l’identification correcte des espèces de Kocuria par des systèmes commerciaux est parfois problématique, car des systèmes tels que Vitek 2 et API Staph n’incluent pas toutes les espèces de Kocuria dans leur base de données (4). Pour cette raison, le séquençage du gène de l’ARNr 16S peut confirmer et établir l’identification des différentes espèces de Kocuria; malheureusement, cette technique n’est cependant pas disponible dans tous les laboratoires de microbiologie. Lorsque le séquençage du gène de l’ARNr 16S n’est pas disponible, une double confirmation avec Vitek 2 et API Staph peut être une option raisonnable.
Les infections chez l’homme causées par des espèces de Kocuria ont inclus une bactériémie liée à un cathéter veineux central, une cholécystite, un abcès cérébral, une endocardite, une synovite, une bursite périarticulaire et, bien sûr, une péritonite chez les patients atteints de MP. On a émis l’hypothèse que la bactériémie liée au cathéter et la péritonite liée à la MP étaient liées à une capacité de Kocuria à produire un biofilm, mais ce potentiel n’a pas été établi jusqu’à récemment. Une étude utilisant à la fois des méthodes dépendantes de la culture et indépendantes, y compris des bibliothèques de clones de gènes de l’ARNr 16S et le pyroséquençage, a récemment montré que K. on trouve des varians dans la flore du biofilm du tube endotrachéal (15). Cette découverte concorde avec la recommandation connue de retirer les cathéters veineux en présence de bactériémies causées par certaines espèces de Kocuria (dont K. kristinae, K. rhizophila et K. rosea), ce qui indique probablement la formation de biofilm (16-18). La capacité de K. varians à former un biofilm peut expliquer en partie la fréquence accrue des péritonites récurrentes dans les cas impliquant cette espèce par rapport aux autres espèces de Kocuria. Néanmoins, une évaluation plus approfondie de la capacité des différentes espèces de Kocuria à produire du biofilm sur certains dispositifs médicaux, tels que les cathéters de Tenckhoff, est nécessaire. Une suggestion de retirer le cathéter de Tenckhoff en cas de péritonite causée par des espèces de Kocuria ne peut pas encore être établie, mais certaines preuves suggèrent une ablation dans les cas de K. varians. Cependant, la capacité des autres espèces de Kocuria à produire un biofilm est inconnue, et compte tenu du fait que le cathéter de Tenckhoff a été retiré dans seulement 2 cas signalés impliquant une péritonite réfractaire et récurrente, toute recommandation de retrait est actuellement problématique.
Les schémas empiriques actuels de péritonite causée par des agents pathogènes à gram positif chez les patients atteints de MP recommandent le plus souvent l’utilisation IP d’une céphalosporine de première génération, telle que la céfazoline ou le céftézole. Cependant, en raison d’un taux élevé d’organismes résistants à la méthicilline, de nombreux programmes utilisent souvent des glycopeptides IP tels que la vancomycine ou la teicoplanine pour une couverture à gram positif. Les épisodes de péritonite signalés chez l’espèce Kocuria ont été causés par des agents pathogènes sensibles aux céphalosporines et aux glycopeptides de première génération; aucune résistance à ces catégories d’antibiotiques ne semble encore apparue. Cependant, dans l’ensemble des infections causées par les espèces de Kocuria, une sensibilité variable aux médicaments bêta-lactamines a été observée. Notamment, aucun cas de résistance aux glycopeptides, aux streptogramines, à l’acide fusidique, à la rifampicine ou au linézolide n’a été rapporté à ce jour (2).
Notre étude a révélé que la durée médiane du traitement IP était de 14 jours, ce qui est conforme aux directives chez les patients atteints de MP pour le traitement de la péritonite causée par des agents pathogènes gram positifs communs et sensibles (6,7). Néanmoins, le patient qui a connu 3 épisodes de péritonite récurrente avec K. les varians ont reçu de la céfazoline IP pendant 10 jours pour le premier épisode, de la céfazoline IP pendant 7 jours après une rechute de péritonite et de la céfazoline IP pendant 14 jours après la deuxième rechute, qui est le schéma thérapeutique officiel suggéré (4). Les recommandations pour éviter la péritonite de l’espèce Kocuria suivent les directives de consensus général pour la prévention des infections liées au cathéter et de la péritonite chez les patients pédiatriques recevant une MP (7).
Cette revue est une première tentative de collecter et d’examiner tous les cas de péritonite à Kocuria publiés chez des patients atteints de MP; il pourrait potentiellement être un outil utile pour de futures études. Cependant, compte tenu du fait qu’il s’agit d’une étude rétrospective multisources d’examen des cas, les limites des données disponibles peuvent nuire à la capacité de tirer des conclusions spécifiques, un problème qui est aggravé par le nombre relativement faible de cas signalés.
