Pour un petit mammifère menacé, cette espèce est bien étudiée. Il occupe une niche qui est remplie ailleurs dans le monde par des lapins. Il construit de longs terriers profonds dans lesquels il dort pendant la journée. Les complexes de terriers typiques ont un diamètre de 5 m et ont 1 à 6 trous. Les entrées de ces trous sont généralement obstruées par une barrière de terre et de feuilles, que les animaux doivent creuser et refermer chaque fois qu’ils entrent et sortent. La nuit, l’espèce émerge pour se nourrir. On pense qu’il se nourrit principalement de fruits, de graines et de feuilles tombés. Exceptionnellement pour les rongeurs, cette espèce est monogame – un couple accouplé et leur progéniture la plus récente vivent ensemble dans un seul terrier. Les paires d’obligations durent apparemment jusqu’à la mort d’un partenaire. Les couples défendent un territoire exclusif d’environ 3,5 ha, marquant leurs pensionnaires avec des dépôts d’urine, de fèces et de glandes odorantes. La densité minimale de population dans l’habitat favorable est de 48/ha. Les mâles atteignent la maturité sexuelle à un an, date à laquelle ils quittent le terrier parental et établissent leurs propres territoires. Les femelles arrivent à maturité à deux ans, mais restent généralement avec leurs parents pendant au moins une saison de reproduction après celle-ci. La reproduction a lieu pendant la saison des pluies (décembre–mars) et les femelles donnent généralement naissance à un ou parfois deux petits. On pense que les femelles sont capables d’accoucher deux fois pendant la saison de reproduction lorsque la nourriture est abondante, bien que cela se produise rarement. La mortalité infantile est élevée, avec seulement environ 50 % des jeunes qui survivent jusqu’à l’âge adulte. L’espèce est une proie importante pour la fosse (Cyprtoprocta ferox) et un boa constricteur terrestre (Acrantophis dumerili). Ils jouent également un rôle important dans la dispersion des graines et aérent le sol grâce à leur comportement fossile. Il y a peu d’informations disponibles sur la durée de vie de cette espèce à l’état sauvage. En captivité, les rats sauteurs géants ont une espérance de vie d’environ 5 ans.
