Samuel Jenness, PhD

Je suis un épidémiologiste des maladies infectieuses spécialisé dans les approches mathématiques et informatiques pour étudier les moteurs et les stratégies de prévention des maladies infectieuses à travers le cadre de réseaux de transmission dynamiques.

En tant que professeur adjoint au Département d’épidémiologie de la Rollins School of Public Health de l’Université Emory, je dirige le laboratoire de recherche EpiModel et collabore également à plusieurs projets de méthodes et d’applications pour l’épidémiologie des maladies infectieuses.

Intérêts de recherche

Mes recherches méthodologiques portent sur le développement d’une plate-forme logicielle ouverte pour la modélisation épidémique, EpiModel, qui permet aux utilisateurs de construire, simuler et analyser des modèles mécanistes complexes pour la transmission de systèmes de maladies infectieuses définis arbitrairement. EpiModel fournit une puissante boîte à outils pour modéliser des réseaux de contacts dynamiques qui sont souvent fondamentaux pour représenter la transmission de maladies nécessitant un contact direct. EpiModel a été utilisé dans plus de 50 publications scientifiques, à la fois par mon groupe et par des chercheurs en modélisation du monde entier!

Mes recherches appliquées portent sur l’épidémiologie du VIH, des infections sexuellement transmissibles et d’autres maladies infectieuses. Je m’intéresse à la façon dont nous pouvons utiliser la modélisation mécaniste et les cadres scientifiques de réseau pour comprendre les moteurs de ces maladies, et pour concevoir et évaluer des stratégies de prévention efficaces. Des applications récentes ont utilisé des modèles pour simuler la co-circulation de plusieurs agents pathogènes co-circulants au sein d’une même population, car les facteurs de risque de contracter une maladie peuvent dépendre de la dynamique épidémique d’autres infections transmises le long du même réseau de contact.

Plus largement, le travail de mon Laboratoire de recherche EpiModel consiste à aborder ces questions par des recherches dans les domaines suivants:

  • Épidémiologie des maladies infectieuses
  • Modélisation mécaniste / mathématique des maladies infectieuses
  • Science de réseau
  • Méthodes d’inférence causale pour l’épidémiologie
  • Conception et analyse de la recherche par sondage
  • Épidémiologie computationnelle & Développement de logiciels scientifiques

Je soutiens et encadre activement les doctorants, les post-doctorants et le personnel de recherche qui travaillent avec moi dans ces domaines.

Nouvelles

2020

2020-11-15

Nouvel article publié dans SIDA: Modélisation d’un Continuum Intégré de Prévention et de Soins du VIH pour atteindre les Objectifs de Fin de l’épidémie de VIH

2020-09-30

Nouvelle pré-impression dans medRxiv: Incidence projetée du VIH et des ITS Bactériennes Suite à la Distanciation Sexuelle liée au COVID et à l’Interruption des Services cliniques

2020-09-03

Un nouvel article dirigé par Kevin Maloney publié dans Journal of Infectious Diseases: Impact projeté de la Prophylaxie Pré-Exposition au VIH Injectable À Action Prolongée et Quotidienne Disponible Simultanément

2020-09-30

Nouvelle pré-impression dans medRxiv: Modélisation de Stratégies de Réseau Dynamiques pour le Contrôle du SRAS-CoV-2 sur un navire de croisière

2020-07-23

Nouvel article dirigé par Christina Chandra publié dans Clinical Infectious Diseases: Lacunes dans le dépistage des Infections Sexuellement Transmissibles chez les Hommes ayant des Rapports sexuels avec des Hommes pendant les soins de PrEP aux États-Unis

2020-07-01

Un nouvel article dirigé par Kristin Nelson publié dans l’American Journal of Epidemiology: Modeling Missing Cases and Transmission Links in Networks of Extensively Drug-Resistant Tuberculosis in KwaZulu-Natal, South Africa

2020-03-01

Nouvel article dirigé par Kevin Weiss publié dans JAIDS: Nombre Estimé d’Hommes Ayant Des Rapports Sexuels Avec des Hommes Ayant des Indications de Prophylaxie Pré-exposition au VIH dans une Étude sur un Réseau Sexuel National

2020-03-01

Nouvel article dirigé par Stephen Uong publié dans Epidemiology: Assessing the Validity of Sexual Network Degree among Men Who Have Sex with Men using Prospective Cohort Data

2020-01-24

Un nouvel article dirigé par Kevin Weiss publié dans Epidemics: Egocentric Sexual Networks of Men Who Have Sex with Men in the United States: Résultats de l’étude ARTnet

2019

2019-11-01

Nouvel article dirigé par Kevin Weiss publié dans Maladies sexuellement Transmissibles: Impact Épidémiologique de la Thérapie de Partenaire Accélérée pour les Hommes Ayant des Rapports Sexuels avec des Hommes: Une étude de modélisation

2019-10-25

Un nouvel article dirigé par Kevin Weiss publié dans le Forum Ouvert Maladies infectieuses: Optimisation de la couverture par rapport à la Fréquence du Dépistage des Infections Sexuellement Transmissibles chez les Hommes Ayant des Rapports Sexuels avec des Hommes

2019-06-07

Nouvel article dirigé par Jeb Jones publié dans Maladies sexuellement Transmissibles: Proportion de Cas de VIH chez les Hommes Ayant des Rapports sexuels avec des Hommes Attribuables à la Gonorrhée et à la Chlamydia: Une Analyse de modélisation.

2018

2018-10-11

Nouvel article publié dans American Journal of Epidemiology: Combler les lacunes dans les Soins de prophylaxie de préexposition au VIH afin de réduire les Disparités Raciales dans l’incidence du VIH aux États-Unis.

2018-07-29

Nouvel article publié dans Maladies Sexuellement Transmissibles: Taux de dépistage des IST Bactériennes par Statut Symptomatique chez les Hommes Ayant des Rapports Sexuels avec des Hommes aux États-Unis: Une Analyse Bayésienne Hiérarchique.

2018-07-12

A reçu un nouveau financement de recherche majeur (mon premier financement R01 en tant qu’IP) des NIH / NIAID (R01 AI138783) pour un projet visant à développer et à étendre la plate-forme EpiModel pour répondre à la prochaine génération d’importantes questions scientifiques de prévention du VIH / IST.

2018-06-18

Nouveau commentaire publié dans Clinical Infectious Diseases: Moving Forward With Treatment of Gonorrhea for Users of Human Immunodeficiency Virus Preexposure Prophylaxis Given the Threat of Antimicrobial Resistance.

2018-04-20

Nouvel article publié dans le Journal of Statistical Software: EpiModel: An R Package for Mathematical Modeling of Infectious Disease over Networks.

2017

2017-09-01

Nouvel article publié dans Maladies Infectieuses Cliniques: Incidence de la Gonorrhée et de la Chlamydia À la suite d’une Prophylaxie de Préexposition au Virus de l’Immunodéficience Humaine Chez Les Hommes Ayant Des Rapports Sexuels Avec des Hommes: Une Étude de Modélisation.

2017-02-15

J’ai reçu mon premier financement des NIH en tant qu’IP (R21 MH112449) pour une nouvelle étude visant à collecter un échantillon national de données en réseau sur les HARSAH pour la modélisation locale de la dynamique de transmission du VIH / IST et des opportunités de prévention.

2017-01-06

Nouvel article publié dans PLoS One: Risque Individuel de VIH par rapport à L’Impact sur la Population de la Compensation du Risque après L’Initiation de la Prophylaxie de Préexposition au VIH chez les Hommes Ayant Des Rapports Sexuels avec des Hommes.

2016

2016-12-01

Le numéro du Journal of Infectious Disease avec notre modèle de préparation au VIH a été publié dans le numéro du 15 décembre et présentait des illustrations de notre étude sur la couverture du numéro.

2016-09-01

A commencé une nouvelle affiliation avec le Centre Nord-Ouest pour la Méthodologie de mise en œuvre de la Prévention (CePIM) en tant que chercheur à un stade précoce, avec un financement pour mener des recherches scientifiques sur le réseau et la mise en œuvre au cours des 5 prochaines années.

2016-07-14

Nouvel article publié dans le Journal of Infectious Diseases: Impact des Directives de Prophylaxie de préexposition au VIH des Centers for Disease Control pour les Hommes Ayant des rapports sexuels avec des Hommes aux États-Unis

2016-06-13

Nouvel article publié dans la revue Infections sexuellement transmissibles: L’efficacité des ensembles combinés pour la prévention du VIH-1 en Afrique subsaharienne dépend de la structure du réseau de partenariat: une étude de modélisation mathématique

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