Les trois principaux kami consacrés sont Daikokuten, Ebisu et Taira no Masakado. Comme Daikokuten et Ebisu appartiennent tous deux aux Sept Dieux de la Fortune, le sanctuaire de Kanda est un lieu populaire pour les hommes d’affaires et les entrepreneurs qui prient pour la richesse et la prospérité.
Taira no Masakado était un fonctionnaire du gouvernement propriétaire de terres qui mena une insurrection massive contre le gouvernement de Heian et se déclara le « Nouvel Empereur » (新皇). Il a ensuite été élevé au statut de kami local par un mélange de peur et de respect. Il est une figure importante de l’histoire du sanctuaire. Après sa défaite en 940 après JC, il a été décapité par Fujiwara no Hidesato et sa tête coupée a été amenée dans la région de Shibasaki (Edo) dans un seau en bois (首桶) et enterrée sur une colline basse près de l’emplacement actuel du sanctuaire. Les habitants qui respectaient son défi et craignaient sa malédiction l’ont enchâssé dans le sanctuaire de Kanda, et son esprit veillerait sur les environs. La rumeur disait que lorsque son sanctuaire tomba en ruine, l’esprit en colère de Masakado provoqua des catastrophes naturelles et des fléaux sur les terres voisines. Il est également dit que Tokugawa Ieyasu se sentait mal à l’aise de voir son château construit à proximité d’un esprit aussi puissant, et a donc décidé de déplacer le sanctuaire de Kanda à son emplacement moderne.
Pendant l’ère Meiji, l’empereur Meiji a été confronté à la pression du public pour inclure le sanctuaire Kanda dans les dix sanctuaires de Tokyo (東京十社, Tokyo Jissha), mais a hésité à le faire en raison de l’association du sanctuaire avec Taira no Masakado, considéré comme un dangereux démagogue anti-gouvernemental. Cela a été temporairement résolu en supprimant Taira no Masakado en tant que kami enchâssé. Cependant, l’esprit de Masakado s’est avéré si populaire parmi les roturiers, qu’il a été symboliquement retourné au sanctuaire après la Seconde Guerre mondiale.