Harvard Medical School
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology (Bcmp)
240 Longwood Ave., C2 épület, szobák 315-325
Boston, MA 02115
a transzkripciós szabályozás molekuláris mechanizmusai erősen konzerváltak az eukarióták között. A transzkripciós szabályozást a környezeti és fejlődési jelekre adott válaszként a specifikus DNS-kötő aktivátorok és represszorok kombinatorikus és szinergikus hatása közvetíti az Általános transzkripciós gép és a kromatin módosító tevékenységek komponenseire.
a laboratóriumban végzett munka nagy része ötvözi az élesztőben elérhető genetikai, molekuláris és genomikai megközelítéseket az élő sejtek transzkripciós szabályozó mechanizmusaival kapcsolatos alapvető kérdések megválaszolására. A jelenlegi projektek tartalmazzák 1) genetikai kísérletek a nukleoszóma pozicionálásának háromlépcsős modelljének tesztelésére; 2) az iniciációban részt vevő általános transzkripciós faktorok szisztematikus elemzése az anchor-away rendszer használatával; 3) a megnyúlásban és a nukleoszóma-kimerülésben részt vevő tényezők vizsgálata 3′ végén; 4) közvetlen RNS-szekvenálás, az mRNS felezési idejének és a 3′-end képződésének genomszintű elemzése, 5) funkcionális evolúciós megközelítés alkalmazása a transzkripciós koaktivátor és Ko-represszor komplexek, valamint a környezeti válaszokat közvetítő aktivátor és represszor kötő helyek szerepének megértésére.
a sejtátalakulásban részt vevő transzkripciós szabályozó áramkörök alapvető fontosságúak, és természetesen közvetlenül relevánsak a rák szempontjából. Az emberi rák két izogén modelljét (emlősejteket és fibroblasztokat) használjuk a transzkripciós szabályozó áramkörök tisztázására, amelyek részt vesznek a sejtátalakulás folyamatában. Ez magában foglalja a gyulladásos visszacsatolási hurok mechanisztikus kísérleteit és a sejtátalakítási folyamat kapcsolódó aspektusait; az mRNS-ek, a mikroRNS-ek és a transzkripciós faktorkötő helyek teljes genomprofiljai, amelyek integrált képet nyújtanak a sejtátalakulásról; valamint a rákos őssejtek és mammoszférák előállításában részt vevő gének, mikroRNS-ek és szabályozó utak azonosítása. A projektek közé tartozik 1) a gömbök mRNS, miRNS és linc RNS profilozása a rákos sejtekkel szemben a különböző típusú rákos sejtekben; 2) riboszóma profilozás a celluláris transzformáció során; és 3) nagyszabású ChIP-Seq kísérletek a transzkripciós faktorok transzformációban betöltött szerepének meghatározására. Végül, miután felfedeztük, hogy a cukorbetegség gyógyszere, a metformin szelektíven megöli a rákos őssejteket, megvizsgáljuk a metformin hatásmechanizmusát és annak lehetőségét a rák megelőzésére és kezelésére.
