Macklis kettős S. B.-t kapott bioelektromos mérnöki és irodalmi szakon a Massachusetts Institute of Technology-tól. 1984–ben doktorált a Harvard-MIT Egészségtudományi és technológiai programján (HST), ahol Richard L. Sidman tanácsolta. Posztdoktori ösztöndíjat végzett a fejlődési idegtudományban Sidmannal. Macklis klinikailag belgyógyászatot tanult a Brigham and Women ‘ s Hospital-ban (BWH) és felnőtt neurológiát a Harvard-Longwood neurológiai képzési programban.
Macklis először a Bostoni Gyermekkórház Idegtudományi Alaptudományi Osztályán (BCH) hozta létre laboratóriumát. 2002-ben a massachusettsi általános kórházba (MGH) költözött, ahol az MGH-HMS idegrendszer-javító Központ alapító igazgatója volt (2002-2011). Társrendezője volt a Parkinson-kór és a kapcsolódó betegségek programjának a BWH-nál.
2004-ben Macklis megalapította a Harvard Egyetem Harvard őssejt Intézetének Idegtudományi / idegrendszeri betegségek programját, amelyet 2013-ig irányított. 2007-ben Macklist az élettudományok Max és Anne Wien professzorává nevezték ki. Laboratóriuma fizikailag Cambridge-be költözött, MA 2011-ben. Ő egy kar tagja a Harvard graduate programs in Neuroscience; biológiai és orvosbiológiai tudományok; fejlődési és regeneratív biológia; és molekulák, sejtek és organizmusok; valamint a Harvard-MIT HST program.
Macklis 2015-ben a Paul G. Allen Frontiers Group kiváló kutatója lett. 2017-ben a Simons Foundation Autism Research Initiative (Sfari) kutatója lett.