Kekkei genkai (血継限界; Szó szerint azt jelenti, “a technika korlátozott öröklési vér szerint” vagy a “Vérvonal Határ”) vagy képességek öröklődött genetikailag meghatározott klánok. Lehetséges, hogy egy nindzsa több ilyen képességgel rendelkezik. Kekkei Genkai képességek, amelyek a felhasználó szemén keresztül működnek, d xhamjutsu-nak nevezzük. Más kekkei genkai magában foglalja az egyik típusú elemi csakra keverését a másikkal, létrehozva egy újat, amely egyedülálló a felhasználók számára, ami általában lehetetlen a normál ninja számára.
Kekkei genkai és a hozzájuk kapcsolódó technikák nem taníthatók vagy másolhatók mások által. A kekkei genkai azonban másoknak is adható. A D-djutsu, vagy más, egyetlen szervhez izolált kekkei genkai átültethető egy másik testébe. Ezeknek a szerveknek a használata sokkal több csakrát igényel, mint valaki, aki a kekkei genkai-val született. A csakra elemeket át lehet adni a klánon kívüli embereknek is, a DNS újbóli módosításával, hogy megszerezzék a felszabadítási technikát. Azonban a személyek készség használata nem lenne közel olyan erős, mint az eredeti gyakorló.
bár a kekkei genkai-k általában genetikailag megosztottak egy adott klánon belül, néha csak egy személyre jellemző, és még a család rokonai sem osztják meg. Úgy tűnik, hogy más kekkei genkai olyan egyénekben jelenik meg, akiknek nincs ismert rokona, például a láva felszabadulása, amely a ninja-ban jelent meg Kirigakure-ból, Iwagakure-ból és Kumogakure-ból, míg a Magnet Release, amely a Ninja-ban megjelent mind Kumogakure-ból, mind Sunagakure-ból.