Harvard Medical School
Dipartimento di Chimica biologica e farmacologia molecolare (BCMP)
240 Longwood Ave. L’hotel è situato nel centro di Boston. 02115
I meccanismi molecolari della regolazione trascrizionale sono altamente conservati tra gli eucarioti. La regolazione trascrizionale in risposta a segnali ambientali e di sviluppo è mediata dall’azione combinatoria e sinergica di specifici attivatori e repressori che legano il DNA sui componenti del macchinario di trascrizione generale e delle attività di modifica della cromatina.
Gran parte del lavoro in questo laboratorio combina approcci genetici, molecolari e genomici disponibili nel lievito per affrontare domande fondamentali sui meccanismi di regolazione trascrizionale nelle cellule viventi. I progetti attuali includono 1) esperimenti genetici per testare il nostro modello in tre fasi per il posizionamento dei nucleosomi; 2) un’analisi sistematica dei fattori generali di trascrizione coinvolti nell’iniziazione utilizzando l’ancora-via sistema; 3) studio dei fattori coinvolti nell’allungamento e nucleosoma deplezione all’estremità 3′; 4) l’utilizzo diretto di RNA sequenziamento di un genoma ampia analisi di mRNA di half-life e 3′-fine formazione, 5) l’uso di un funzionale approccio evolutivo per capire i ruoli dei vari trascritti così come i componenti specifici del coattivatore trascrizionale e co-repressore complessi e attivatore e repressore siti di legame di mediazione ambientale risposte.
I circuiti regolatori trascrizionali coinvolti nella trasformazione cellulare sono di fondamentale importanza e, naturalmente, direttamente rilevanti per il cancro. Stiamo usando due modelli isogenici (cellule mammarie e fibroblasti) del cancro umano per chiarire i circuiti regolatori trascrizionali coinvolti nel processo di trasformazione cellulare. Ciò comporta esperimenti meccanicistici sul ciclo di feedback infiammatorio e aspetti correlati del processo di trasformazione cellulare; profili dell’intero genoma di MRNA, microRNA e siti di legame del fattore di trascrizione per fornire una visione integrata della trasformazione cellulare; e identificare geni, microRNA e percorsi regolatori coinvolti nella generazione di cellule staminali tumorali e mammosfere. I progetti includono 1) mRNA, miRNA e linc RNA profiling di sfere vs. cellule tumorali in diversi tipi di cellule tumorali; 2) ribosoma profiling durante la trasformazione cellulare; e 3) esperimenti ChIP-Seq su larga scala per determinare il ruolo dei fattori di trascrizione nella trasformazione. Infine, avendo scoperto che il farmaco per il diabete metformina uccide selettivamente le cellule staminali tumorali, stiamo studiando il meccanismo dell’azione della metformina e il suo potenziale per la prevenzione e il trattamento del cancro.
