Nel 1980, due visitatori della grotta contrassero il virus Marburg. Nel 1980, un uomo francese morì a causa del virus dopo aver visitato la grotta, e nel 1987 anche un ragazzo danese di 15 anni si ammalò e morì dopo aver visitato la grotta. Due ceppi del virus sono stati catalogati da queste infezioni: il ceppo 1980 prende il nome da un medico, Shem Musoke, sopravvissuto all’infezione dal paziente francese; il ceppo 1987 si chiama Ravn, dal cognome del paziente danese. Sulla base di questi casi, una spedizione è stata organizzata dall’United States Army Medical Research Institute of Infectious Disease (USAMRIID) nel tentativo di identificare le specie vettoriali presumibilmente residenti nella grotta. Nonostante il campionamento di un’ampia varietà di specie (compresi i pipistrelli della frutta), non è stato trovato alcun Marburg e il vettore animale è rimasto un mistero. Questi eventi sono stati drammatizzati da Richard Preston nel libro best-seller The Hot Zone (1994).
Nel settembre 2007, spedizioni simili a miniere attive in Gabon e Uganda hanno trovato solide prove di serbatoi di Marburg in pipistrelli della frutta egiziani che vivono nelle caverne. Le miniere ugandesi avevano entrambe colonie della stessa specie di pipistrelli della frutta africani che colonizzano Kitum Cave, suggerendo che il vettore a lungo ricercato a Kitum era davvero i pipistrelli e il loro guano. Lo studio è stato condotto dopo che due minatori hanno contratto Marburg nell’agosto 2007, entrambi senza essere morsi da pipistrelli, suggerendo che il virus può essere propagato attraverso l’inalazione di guano in polvere.
