Kekkei genkai (血継限界; letteralmente significa “una tecnica limitata all’eredità dal sangue” o “Limite della linea di sangue”) sono abilità tramandate geneticamente in clan specifici. È possibile che un ninja abbia più di una di queste abilità. Le abilità Kekkei genkai che funzionano tramite l’occhio dell’utente sono chiamate dōjutsu. Altri kekkei genkai includono la miscelazione di un tipo di chakra elementale con un altro, la creazione di uno nuovo unico per gli utenti, che di solito è impossibile per ninja normale.
Kekkei genkai e le relative tecniche non possono essere insegnate o copiate da altri. Tuttavia, kekkei genkai può essere dato ad altri. Il Dōjutsu, o altro genkai kekkei isolato in un singolo organo, può essere trapiantato nel corpo di un altro. L’uso di questi organi richiede molto più chakra di qualcuno nato con il kekkei genkai. Gli elementi Chakra possono anche essere trasmessi a persone al di fuori del clan, passando attraverso una ri-modifica del DNA per acquisire la tecnica di rilascio. Tuttavia, l’abilità delle persone nell’usarla non sarebbe così potente come il praticante originale.
Anche se i kekkei genkai sono di solito condivisi geneticamente all’interno di un clan specifico, a volte è unico per una sola persona, e che anche i parenti familiari non lo condividono. Tuttavia altri kekkei genkai sembrano apparire in individui senza alcuna relazione nota, come il Rilascio di Lava, che è apparso in ninja da Kirigakure, Iwagakure e Kumogakure, mentre il rilascio di Magnete, che è apparso in ninja da Kumogakure e Sunagakure.
