I tre principali kami sanciti sono Daikokuten, Ebisu e Taira no Masakado. Poiché Daikokuten ed Ebisu appartengono entrambi ai Sette Dei della Fortuna, il Santuario di Kanda è un luogo popolare per uomini d’affari e imprenditori per pregare per ricchezza e prosperità.
Taira no Masakado era un funzionario del governo proprietario di terreni che guidò una massiccia insurrezione contro il governo Heian e si dichiarò il “Nuovo Imperatore” (新皇). In seguito fu elevato allo status di kami locale da un misto di paura e riverenza. È una figura importante nella storia del santuario. Dopo la sua sconfitta nel 940 DC, fu decapitato da Fujiwara no Hidesato e la sua testa mozzata fu portata nella zona di Shibasaki (Edo) in un secchio di legno (首桶) e sepolta su una bassa collina vicino alla posizione del santuario oggi. La gente del posto che rispettava la sua sfida, e temendo la sua maledizione, lo ha consacrato nel Santuario di Kanda, e il suo spirito si dice che sorveglia le aree circostanti. Si diceva che quando il suo santuario cadde in rovina, lo spirito arrabbiato di Masakado causò disastri naturali e piaghe sulle terre vicine. Si dice anche che Tokugawa Ieyasu si sentì a disagio per avere il suo castello costruito vicino a uno spirito così potente, e così decise di spostare il Santuario di Kanda nella sua posizione moderna.
Durante il periodo Meiji, l’imperatore Meiji dovette affrontare pressioni pubbliche per includere il Santuario di Kanda nei Dieci Santuari di Tokyo (Tokyo京 Tokyo, Tokyo Jissha), ma esitò a farlo a causa dell’associazione del santuario con Taira no Masakado, che era visto come un pericoloso demagogo anti-governativo. Questo è stato temporaneamente risolto rimuovendo Taira no Masakado come un kami sancito. Tuttavia, lo spirito di Masakado si dimostrò così popolare tra la gente comune, che fu simbolicamente restituito al santuario dopo la seconda guerra mondiale.