キノメ

この記事は分子生物学の用語についてです。 植物および食糧のために、Zanthoxylum piperitumを見て下さい。

分子生物学、生化学および細胞シグナル伝達において、生物のキノームは、そのゲノムにコードされるプロテインキナーゼの完全なセットである。 キナーゼは通常、(アミノ酸の)リン酸化反応を触媒し、いくつかのグループおよびファミリー、例えば、アミノ酸セリンおよびスレオニンをリン酸化する酵素、チロシンをリン酸化する酵素、およびMAP2KおよびGSKファミリーのような両方をリン酸化することができるいくつかに分類される酵素である。 この用語は、2002年にGerard Manningらによって、518個のヒトプロテインキナーゼを解析した双子の論文で初めて使用され、プロテインキナーゼとタンパク質擬似キナーゼの両方、および真核生物全体におけるプロテインキナーゼの進化を指している。 他のキノームは、イネ、いくつかの真菌、線虫、昆虫、ウニ、Dictyostelium discoideum、および結核菌による感染のプロセスについて決定されている。 プロテインキナーゼの一次配列は無関係な真核生物間の実質的な相違を示し、触媒モチーフのアミノ酸の違いは、キノームの正準および偽キナーゼサブタイプへの分離を可能にしているが、真核生物のキナーゼによる基質の実際のリン酸化の部位に隣接するアミノ酸モチーフに見られる変化ははるかに小さい。

キナーゼは主要な薬物標的であり、細胞挙動の主要な制御点であるため、キノームはRNAiスクリーンを用いた大規模な機能ゲノミクス、特に癌治療における創薬努力の標的となっている。

動物では、キノームにはチロシンのみをリン酸化するキナーゼ(チロシンキナーゼ)、セリンまたはスレオニンに作用するキナーゼ、およびGSK3およびMAP2Kのようなその両方に作用するいくつかのクラスが含まれる。 研究はBRCAおよびFHAの範囲のようなリン酸化されたセリンおよびスレオニンの残余に、結合する専門にされた蛋白質の範囲があることを示しました。

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