要約
哺乳類のゲノムは二倍体であるが、これまでの研究では、相同染色体の違いを考慮せずに平均クロマチンアーキテクチャを広範囲に調べた。 我々は、二倍体クロマチン組織とエピジェネティックな調節を調べるために、B6、キャスト、およびハイブリッドマウスのCD4T細胞からHi-C、ChIP-seq、およびRNA-seqデータセットを生成しました。.こんにちこんにちこんにちは、二倍体クロマチン組織とエピジェネティックな調節を調査しました。 我々のデータは、相同染色体間の染色体間相互作用パターンが類似していることを示し、類似性は非常にそれらの対立遺伝子共発現レベルと相関している。 3D核の再構成は、核の中心への相同染色体の距離がほぼ同じであることを明らかにした。 動原体末端の染色体間相互作用はテロメア末端のものよりも有意に弱く，染色体領域内の異なる領域に位置していることを示唆した。 A|Bコンパートメントまたはトポロジカルに関連するドメイン（TADs）の大部分は、B6とキャストの間で一貫しています。 我々は、ハイブリッドの半数体の58％がcis効果のためにB6/キャスト発散コンパートメントでその親のコンパートメントの状態を維持することがわか トランス効果B6/キャスト発散コンパートメントの約95％は、潜在的に共有細胞環境のために同じコンパートメントの状態に収束します。 ハイブリッドにおける二つのハプロイド間の差動発現遺伝子は遺伝的またはエピジェネティックな効果のいずれかに関連していたことを示した。 要約すると、ハイブリッドマウスからの私たちのマルチオミクスデータは、3D核アーキテクチャ上の一倍体特異的な情報とさらに一倍体特異的遺伝子発現のエピジェネティックな調節を理解するための豊富なリソースを提供しました。
